Protein–RNA interactions for Protein: Q13228

SELENBP1, Selenium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENBP1Q13228 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SELENBP1Q13228 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SELENBP1Q13228 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SELENBP1Q13228 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SELENBP1Q13228 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SELENBP1Q13228 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SELENBP1Q13228 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SELENBP1Q13228 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SELENBP1Q13228 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SELENBP1Q13228 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SELENBP1Q13228 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SELENBP1Q13228 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SELENBP1Q13228 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SELENBP1Q13228 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SELENBP1Q13228 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SELENBP1Q13228 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SELENBP1Q13228 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SELENBP1Q13228 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SELENBP1Q13228 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SELENBP1Q13228 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SELENBP1Q13228 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SELENBP1Q13228 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SELENBP1Q13228 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SELENBP1Q13228 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SELENBP1Q13228 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SELENBP1Q13228 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SELENBP1Q13228 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SELENBP1Q13228 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SELENBP1Q13228 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SELENBP1Q13228 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SELENBP1Q13228 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SELENBP1Q13228 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SELENBP1Q13228 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SELENBP1Q13228 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SELENBP1Q13228 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SELENBP1Q13228 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SELENBP1Q13228 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SELENBP1Q13228 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SELENBP1Q13228 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SELENBP1Q13228 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SELENBP1Q13228 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SELENBP1Q13228 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SELENBP1Q13228 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SELENBP1Q13228 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SELENBP1Q13228 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SELENBP1Q13228 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SELENBP1Q13228 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SELENBP1Q13228 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SELENBP1Q13228 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SELENBP1Q13228 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SELENBP1Q13228 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SELENBP1Q13228 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SELENBP1Q13228 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SELENBP1Q13228 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SELENBP1Q13228 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SELENBP1Q13228 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SELENBP1Q13228 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SELENBP1Q13228 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SELENBP1Q13228 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SELENBP1Q13228 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SELENBP1Q13228 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SELENBP1Q13228 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SELENBP1Q13228 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SELENBP1Q13228 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SELENBP1Q13228 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SELENBP1Q13228 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SELENBP1Q13228 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SELENBP1Q13228 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SELENBP1Q13228 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SELENBP1Q13228 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SELENBP1Q13228 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SELENBP1Q13228 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SELENBP1Q13228 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SELENBP1Q13228 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SELENBP1Q13228 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SELENBP1Q13228 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SELENBP1Q13228 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SELENBP1Q13228 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SELENBP1Q13228 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SELENBP1Q13228 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SELENBP1Q13228 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SELENBP1Q13228 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SELENBP1Q13228 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SELENBP1Q13228 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SELENBP1Q13228 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SELENBP1Q13228 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SELENBP1Q13228 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SELENBP1Q13228 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SELENBP1Q13228 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SELENBP1Q13228 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SELENBP1Q13228 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SELENBP1Q13228 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SELENBP1Q13228 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SELENBP1Q13228 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SELENBP1Q13228 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SELENBP1Q13228 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SELENBP1Q13228 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SELENBP1Q13228 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SELENBP1Q13228 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SELENBP1Q13228 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
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