Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ECH1Q13011 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ECH1Q13011 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ECH1Q13011 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ECH1Q13011 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECH1Q13011 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECH1Q13011 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ECH1Q13011 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECH1Q13011 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECH1Q13011 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECH1Q13011 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECH1Q13011 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECH1Q13011 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECH1Q13011 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECH1Q13011 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECH1Q13011 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECH1Q13011 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECH1Q13011 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECH1Q13011 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ECH1Q13011 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ECH1Q13011 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ECH1Q13011 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ECH1Q13011 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECH1Q13011 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECH1Q13011 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECH1Q13011 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECH1Q13011 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECH1Q13011 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECH1Q13011 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECH1Q13011 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ECH1Q13011 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECH1Q13011 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECH1Q13011 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECH1Q13011 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECH1Q13011 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECH1Q13011 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECH1Q13011 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECH1Q13011 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECH1Q13011 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECH1Q13011 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ECH1Q13011 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECH1Q13011 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECH1Q13011 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECH1Q13011 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ECH1Q13011 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ECH1Q13011 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECH1Q13011 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECH1Q13011 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECH1Q13011 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECH1Q13011 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECH1Q13011 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECH1Q13011 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECH1Q13011 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECH1Q13011 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECH1Q13011 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECH1Q13011 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECH1Q13011 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ECH1Q13011 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECH1Q13011 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECH1Q13011 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECH1Q13011 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ECH1Q13011 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ECH1Q13011 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ECH1Q13011 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ECH1Q13011 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ECH1Q13011 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ECH1Q13011 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
ECH1Q13011 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECH1Q13011 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECH1Q13011 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECH1Q13011 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECH1Q13011 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECH1Q13011 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECH1Q13011 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECH1Q13011 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECH1Q13011 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECH1Q13011 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECH1Q13011 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ECH1Q13011 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECH1Q13011 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECH1Q13011 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECH1Q13011 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECH1Q13011 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECH1Q13011 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECH1Q13011 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECH1Q13011 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECH1Q13011 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECH1Q13011 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECH1Q13011 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECH1Q13011 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECH1Q13011 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECH1Q13011 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECH1Q13011 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECH1Q13011 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECH1Q13011 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECH1Q13011 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ECH1Q13011 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECH1Q13011 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECH1Q13011 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ECH1Q13011 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
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