Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMARCB1Q12824 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMARCB1Q12824 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMARCB1Q12824 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMARCB1Q12824 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMARCB1Q12824 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMARCB1Q12824 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMARCB1Q12824 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMARCB1Q12824 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMARCB1Q12824 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMARCB1Q12824 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMARCB1Q12824 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SMARCB1Q12824 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMARCB1Q12824 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMARCB1Q12824 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMARCB1Q12824 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMARCB1Q12824 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMARCB1Q12824 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMARCB1Q12824 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMARCB1Q12824 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SMARCB1Q12824 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMARCB1Q12824 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SMARCB1Q12824 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMARCB1Q12824 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMARCB1Q12824 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMARCB1Q12824 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMARCB1Q12824 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SMARCB1Q12824 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMARCB1Q12824 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMARCB1Q12824 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMARCB1Q12824 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMARCB1Q12824 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMARCB1Q12824 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SMARCB1Q12824 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMARCB1Q12824 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMARCB1Q12824 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMARCB1Q12824 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SMARCB1Q12824 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMARCB1Q12824 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SMARCB1Q12824 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMARCB1Q12824 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SMARCB1Q12824 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMARCB1Q12824 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCB1Q12824 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCB1Q12824 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCB1Q12824 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCB1Q12824 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCB1Q12824 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCB1Q12824 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCB1Q12824 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCB1Q12824 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCB1Q12824 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCB1Q12824 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCB1Q12824 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCB1Q12824 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCB1Q12824 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCB1Q12824 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCB1Q12824 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCB1Q12824 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCB1Q12824 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCB1Q12824 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCB1Q12824 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCB1Q12824 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCB1Q12824 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCB1Q12824 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCB1Q12824 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCB1Q12824 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCB1Q12824 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCB1Q12824 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCB1Q12824 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCB1Q12824 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCB1Q12824 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCB1Q12824 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCB1Q12824 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SMARCB1Q12824 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCB1Q12824 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCB1Q12824 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCB1Q12824 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCB1Q12824 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCB1Q12824 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCB1Q12824 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCB1Q12824 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCB1Q12824 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCB1Q12824 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCB1Q12824 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCB1Q12824 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCB1Q12824 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCB1Q12824 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCB1Q12824 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCB1Q12824 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCB1Q12824 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCB1Q12824 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCB1Q12824 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCB1Q12824 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCB1Q12824 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMARCB1Q12824 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMARCB1Q12824 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMARCB1Q12824 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SMARCB1Q12824 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMARCB1Q12824 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
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