Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXO1Q12778 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXO1Q12778 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXO1Q12778 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXO1Q12778 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXO1Q12778 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXO1Q12778 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXO1Q12778 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXO1Q12778 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXO1Q12778 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXO1Q12778 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXO1Q12778 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXO1Q12778 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXO1Q12778 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXO1Q12778 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXO1Q12778 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXO1Q12778 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXO1Q12778 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXO1Q12778 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXO1Q12778 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXO1Q12778 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
FOXO1Q12778 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
FOXO1Q12778 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXO1Q12778 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXO1Q12778 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXO1Q12778 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXO1Q12778 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXO1Q12778 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXO1Q12778 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXO1Q12778 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXO1Q12778 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXO1Q12778 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXO1Q12778 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXO1Q12778 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXO1Q12778 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXO1Q12778 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXO1Q12778 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXO1Q12778 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXO1Q12778 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXO1Q12778 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXO1Q12778 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXO1Q12778 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXO1Q12778 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXO1Q12778 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXO1Q12778 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXO1Q12778 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXO1Q12778 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXO1Q12778 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXO1Q12778 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXO1Q12778 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXO1Q12778 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXO1Q12778 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXO1Q12778 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXO1Q12778 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FOXO1Q12778 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXO1Q12778 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXO1Q12778 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXO1Q12778 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXO1Q12778 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXO1Q12778 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXO1Q12778 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXO1Q12778 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXO1Q12778 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXO1Q12778 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXO1Q12778 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXO1Q12778 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXO1Q12778 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXO1Q12778 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXO1Q12778 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXO1Q12778 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXO1Q12778 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXO1Q12778 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXO1Q12778 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXO1Q12778 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXO1Q12778 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXO1Q12778 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXO1Q12778 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXO1Q12778 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXO1Q12778 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXO1Q12778 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXO1Q12778 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXO1Q12778 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXO1Q12778 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXO1Q12778 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXO1Q12778 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXO1Q12778 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXO1Q12778 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXO1Q12778 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXO1Q12778 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXO1Q12778 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXO1Q12778 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXO1Q12778 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXO1Q12778 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXO1Q12778 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
FOXO1Q12778 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOXO1Q12778 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXO1Q12778 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXO1Q12778 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXO1Q12778 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXO1Q12778 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
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