Protein–RNA interactions for Protein: Q12277

RRP42, Exosome complex component RRP42, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP42Q12277 REC107YJR021C 945 nt6.62□□□□□ -1.35
RRP42Q12277 YLL056CYLL056C 897 nt6.62□□□□□ -1.35
RRP42Q12277 YOR012WYOR012W 414 nt6.62□□□□□ -1.35
RRP42Q12277 TOS2YGR221C 1869 nt6.62□□□□□ -1.35
RRP42Q12277 COX15YER141W 1461 nt6.61□□□□□ -1.35
RRP42Q12277 PPH21YDL134C 1110 nt6.61□□□□□ -1.35
RRP42Q12277 MTR3YGR158C 753 nt6.61□□□□□ -1.35
RRP42Q12277 SPG5YMR191W 1122 nt6.61□□□□□ -1.35
RRP42Q12277 PUS4YNL292W 1212 nt6.61□□□□□ -1.35
RRP42Q12277 RFS1YBR052C 633 nt6.61□□□□□ -1.35
RRP42Q12277 MPH3YJR160C 1809 nt6.6□□□□□ -1.35
RRP42Q12277 SMX3YPR182W 261 nt6.6□□□□□ -1.35
RRP42Q12277 AMN1YBR158W 1650 nt6.6□□□□□ -1.35
RRP42Q12277 YLL058WYLL058W 1728 nt6.59□□□□□ -1.35
RRP42Q12277 CEM1YER061C 1329 nt6.59□□□□□ -1.35
RRP42Q12277 CYS4YGR155W 1524 nt6.59□□□□□ -1.35
RRP42Q12277 YMR034CYMR034C 1305 nt6.58□□□□□ -1.36
RRP42Q12277 TUF1YOR187W 1314 nt6.58□□□□□ -1.36
RRP42Q12277 MRPL28YDR462W 444 nt6.58□□□□□ -1.36
RRP42Q12277 LIA1YJR070C 978 nt6.58□□□□□ -1.36
RRP42Q12277 RPL31BYLR406C 342 nt6.58□□□□□ -1.36
RRP42Q12277 ASR1YPR093C 867 nt6.58□□□□□ -1.36
RRP42Q12277 NUP49YGL172W 1419 nt6.58□□□□□ -1.36
RRP42Q12277 HSM3YBR272C 1443 nt6.58□□□□□ -1.36
RRP42Q12277 ICP55YER078C 1536 nt6.57□□□□□ -1.36
RRP42Q12277 PRI1YIR008C 1230 nt6.57□□□□□ -1.36
RRP42Q12277 HOC1YJR075W 1191 nt6.57□□□□□ -1.36
RRP42Q12277 AGP2YBR132C 1791 nt6.57□□□□□ -1.36
RRP42Q12277 MCH2YKL221W 1422 nt6.56□□□□□ -1.36
RRP42Q12277 VTS1YOR359W 1572 nt6.56□□□□□ -1.36
RRP42Q12277 DAL7YIR031C 1665 nt6.55□□□□□ -1.36
RRP42Q12277 MSC3YLR219W 2187 nt6.55□□□□□ -1.36
RRP42Q12277 GPD1YDL022W 1176 nt6.55□□□□□ -1.36
RRP42Q12277 MRPS28YDR337W 861 nt6.55□□□□□ -1.36
RRP42Q12277 TRR1YDR353W 960 nt6.55□□□□□ -1.36
RRP42Q12277 PAC10YGR078C 600 nt6.55□□□□□ -1.36
RRP42Q12277 ARC35YNR035C 1029 nt6.55□□□□□ -1.36
RRP42Q12277 SSC1YJR045C 1965 nt6.55□□□□□ -1.36
RRP42Q12277 PPS1YBR276C 2424 nt6.55□□□□□ -1.36
RRP42Q12277 RDN5-2RDN5-2 119 nt6.54□□□□□ -1.36
RRP42Q12277 RDN5-3RDN5-3 119 nt6.54□□□□□ -1.36
RRP42Q12277 RDN5-4RDN5-4 119 nt6.54□□□□□ -1.36
RRP42Q12277 RDN5-5RDN5-5 119 nt6.54□□□□□ -1.36
RRP42Q12277 PAC2YER007W 1557 nt6.53□□□□□ -1.36
RRP42Q12277 ERS1YCR075C 783 nt6.53□□□□□ -1.36
RRP42Q12277 FMP40YPL222W 2067 nt6.53□□□□□ -1.36
RRP42Q12277 HED1YDR014W-A 489 nt6.52□□□□□ -1.37
RRP42Q12277 MRPL35YDR322W 1104 nt6.52□□□□□ -1.37
RRP42Q12277 URH1YDR400W 1023 nt6.52□□□□□ -1.37
RRP42Q12277 CBR1YIL043C 855 nt6.52□□□□□ -1.37
RRP42Q12277 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt6.52□□□□□ -1.37
RRP42Q12277 SWD1YAR003W 1281 nt6.52□□□□□ -1.37
RRP42Q12277 NUP84YDL116W 2181 nt6.52□□□□□ -1.37
RRP42Q12277 FCY22YER060W-A 1593 nt6.52□□□□□ -1.37
RRP42Q12277 YOR389WYOR389W 1875 nt6.51□□□□□ -1.37
RRP42Q12277 YDL177CYDL177C 513 nt6.51□□□□□ -1.37
RRP42Q12277 YSC83YHR017W 1158 nt6.51□□□□□ -1.37
RRP42Q12277 TMA46YOR091W 1038 nt6.51□□□□□ -1.37
RRP42Q12277 NME1NME1 340 nt6.51□□□□□ -1.37
RRP42Q12277 ADE17YMR120C 1779 nt6.51□□□□□ -1.37
RRP42Q12277 NMD5YJR132W 3147 nt6.5□□□□□ -1.37
RRP42Q12277 NAS6YGR232W 687 nt6.5□□□□□ -1.37
RRP42Q12277 HBN1YCL026C-B 582 nt6.5□□□□□ -1.37
RRP42Q12277 PRP2YNR011C 2631 nt6.49□□□□□ -1.37
RRP42Q12277 TAH11YJR046W 1815 nt6.49□□□□□ -1.37
RRP42Q12277 TRS31YDR472W 852 nt6.49□□□□□ -1.37
RRP42Q12277 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt6.49□□□□□ -1.37
RRP42Q12277 SEC62YPL094C 825 nt6.49□□□□□ -1.37
RRP42Q12277 CYB2YML054C 1776 nt6.49□□□□□ -1.37
RRP42Q12277 ERG12YMR208W 1332 nt6.49□□□□□ -1.37
RRP42Q12277 YBR241CYBR241C 1467 nt6.48□□□□□ -1.37
RRP42Q12277 PPM2YOL141W 2088 nt6.48□□□□□ -1.37
RRP42Q12277 YOS9YDR057W 1629 nt6.48□□□□□ -1.37
RRP42Q12277 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt6.48□□□□□ -1.37
RRP42Q12277 ASF1YJL115W 840 nt6.48□□□□□ -1.37
RRP42Q12277 YOR111WYOR111W 699 nt6.48□□□□□ -1.37
RRP42Q12277 CRH1YGR189C 1524 nt6.48□□□□□ -1.37
RRP42Q12277 ASN2YGR124W 1719 nt6.47□□□□□ -1.37
RRP42Q12277 HHY1YEL059W 309 nt6.47□□□□□ -1.37
RRP42Q12277 LCL3YGL085W 825 nt6.47□□□□□ -1.37
RRP42Q12277 RPL2BYIL018W 765 nt6.47□□□□□ -1.37
RRP42Q12277 MET8YBR213W 825 nt6.47□□□□□ -1.37
RRP42Q12277 YHR020WYHR020W 2067 nt6.46□□□□□ -1.37
RRP42Q12277 ATG36YJL185C 882 nt6.46□□□□□ -1.38
RRP42Q12277 RNH1YMR234W 1047 nt6.46□□□□□ -1.38
RRP42Q12277 CIR2YOR356W 1896 nt6.45□□□□□ -1.38
RRP42Q12277 TAF9YMR236W 474 nt6.45□□□□□ -1.38
RRP42Q12277 YNL092WYNL092W 1203 nt6.45□□□□□ -1.38
RRP42Q12277 LSC1YOR142W 990 nt6.45□□□□□ -1.38
RRP42Q12277 MLS1YNL117W 1665 nt6.45□□□□□ -1.38
RRP42Q12277 RGD2YFL047W 2145 nt6.44□□□□□ -1.38
RRP42Q12277 SGE1YPR198W 1632 nt6.44□□□□□ -1.38
RRP42Q12277 FMO1YHR176W 1299 nt6.44□□□□□ -1.38
RRP42Q12277 MGM101YJR144W 810 nt6.44□□□□□ -1.38
RRP42Q12277 YKL102CYKL102C 306 nt6.44□□□□□ -1.38
RRP42Q12277 YBR113WYBR113W 483 nt6.44□□□□□ -1.38
RRP42Q12277 YEN1YER041W 2280 nt6.44□□□□□ -1.38
RRP42Q12277 DOT1YDR440W 1749 nt6.44□□□□□ -1.38
RRP42Q12277 YHR131CYHR131C 2553 nt6.44□□□□□ -1.38
RRP42Q12277 CCT3YJL014W 1605 nt6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.2 ms