Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIPPLY1Q0D2K3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIPPLY1Q0D2K3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIPPLY1Q0D2K3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIPPLY1Q0D2K3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RIPPLY1Q0D2K3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RIPPLY1Q0D2K3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RIPPLY1Q0D2K3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIPPLY1Q0D2K3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIPPLY1Q0D2K3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIPPLY1Q0D2K3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIPPLY1Q0D2K3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIPPLY1Q0D2K3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIPPLY1Q0D2K3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIPPLY1Q0D2K3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIPPLY1Q0D2K3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIPPLY1Q0D2K3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIPPLY1Q0D2K3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIPPLY1Q0D2K3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIPPLY1Q0D2K3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RIPPLY1Q0D2K3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RIPPLY1Q0D2K3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RIPPLY1Q0D2K3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RIPPLY1Q0D2K3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RIPPLY1Q0D2K3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RIPPLY1Q0D2K3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RIPPLY1Q0D2K3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RIPPLY1Q0D2K3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RIPPLY1Q0D2K3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RIPPLY1Q0D2K3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RIPPLY1Q0D2K3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RIPPLY1Q0D2K3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RIPPLY1Q0D2K3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RIPPLY1Q0D2K3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RIPPLY1Q0D2K3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RIPPLY1Q0D2K3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIPPLY1Q0D2K3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIPPLY1Q0D2K3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIPPLY1Q0D2K3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIPPLY1Q0D2K3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RIPPLY1Q0D2K3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RIPPLY1Q0D2K3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RIPPLY1Q0D2K3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RIPPLY1Q0D2K3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RIPPLY1Q0D2K3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIPPLY1Q0D2K3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIPPLY1Q0D2K3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIPPLY1Q0D2K3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIPPLY1Q0D2K3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIPPLY1Q0D2K3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIPPLY1Q0D2K3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIPPLY1Q0D2K3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIPPLY1Q0D2K3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIPPLY1Q0D2K3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIPPLY1Q0D2K3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIPPLY1Q0D2K3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIPPLY1Q0D2K3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RIPPLY1Q0D2K3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RIPPLY1Q0D2K3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RIPPLY1Q0D2K3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RIPPLY1Q0D2K3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RIPPLY1Q0D2K3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RIPPLY1Q0D2K3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RIPPLY1Q0D2K3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RIPPLY1Q0D2K3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RIPPLY1Q0D2K3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RIPPLY1Q0D2K3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RIPPLY1Q0D2K3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RIPPLY1Q0D2K3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RIPPLY1Q0D2K3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RIPPLY1Q0D2K3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RIPPLY1Q0D2K3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RIPPLY1Q0D2K3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RIPPLY1Q0D2K3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RIPPLY1Q0D2K3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RIPPLY1Q0D2K3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RIPPLY1Q0D2K3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RIPPLY1Q0D2K3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RIPPLY1Q0D2K3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RIPPLY1Q0D2K3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RIPPLY1Q0D2K3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RIPPLY1Q0D2K3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RIPPLY1Q0D2K3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RIPPLY1Q0D2K3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RIPPLY1Q0D2K3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RIPPLY1Q0D2K3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RIPPLY1Q0D2K3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RIPPLY1Q0D2K3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RIPPLY1Q0D2K3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RIPPLY1Q0D2K3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RIPPLY1Q0D2K3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RIPPLY1Q0D2K3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RIPPLY1Q0D2K3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms