Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPP3CAQ08209 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPP3CAQ08209 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPP3CAQ08209 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPP3CAQ08209 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPP3CAQ08209 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPP3CAQ08209 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPP3CAQ08209 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPP3CAQ08209 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPP3CAQ08209 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPP3CAQ08209 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPP3CAQ08209 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPP3CAQ08209 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPP3CAQ08209 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPP3CAQ08209 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPP3CAQ08209 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPP3CAQ08209 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPP3CAQ08209 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPP3CAQ08209 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPP3CAQ08209 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPP3CAQ08209 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPP3CAQ08209 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPP3CAQ08209 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPP3CAQ08209 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPP3CAQ08209 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPP3CAQ08209 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPP3CAQ08209 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPP3CAQ08209 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPP3CAQ08209 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPP3CAQ08209 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPP3CAQ08209 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPP3CAQ08209 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PPP3CAQ08209 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPP3CAQ08209 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPP3CAQ08209 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPP3CAQ08209 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PPP3CAQ08209 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPP3CAQ08209 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPP3CAQ08209 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPP3CAQ08209 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPP3CAQ08209 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPP3CAQ08209 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPP3CAQ08209 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPP3CAQ08209 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPP3CAQ08209 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPP3CAQ08209 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPP3CAQ08209 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPP3CAQ08209 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPP3CAQ08209 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPP3CAQ08209 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPP3CAQ08209 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPP3CAQ08209 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPP3CAQ08209 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPP3CAQ08209 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPP3CAQ08209 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPP3CAQ08209 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPP3CAQ08209 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPP3CAQ08209 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPP3CAQ08209 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPP3CAQ08209 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PPP3CAQ08209 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPP3CAQ08209 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPP3CAQ08209 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPP3CAQ08209 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPP3CAQ08209 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPP3CAQ08209 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PPP3CAQ08209 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPP3CAQ08209 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPP3CAQ08209 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPP3CAQ08209 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPP3CAQ08209 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPP3CAQ08209 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPP3CAQ08209 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPP3CAQ08209 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPP3CAQ08209 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPP3CAQ08209 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPP3CAQ08209 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPP3CAQ08209 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPP3CAQ08209 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPP3CAQ08209 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPP3CAQ08209 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPP3CAQ08209 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPP3CAQ08209 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPP3CAQ08209 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPP3CAQ08209 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPP3CAQ08209 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPP3CAQ08209 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PPP3CAQ08209 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPP3CAQ08209 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPP3CAQ08209 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPP3CAQ08209 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPP3CAQ08209 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPP3CAQ08209 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPP3CAQ08209 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPP3CAQ08209 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPP3CAQ08209 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPP3CAQ08209 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPP3CAQ08209 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPP3CAQ08209 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPP3CAQ08209 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms