Protein–RNA interactions for Protein: Q05397

PTK2, Focal adhesion kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK2Q05397 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PTK2Q05397 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PTK2Q05397 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTK2Q05397 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTK2Q05397 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTK2Q05397 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTK2Q05397 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTK2Q05397 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTK2Q05397 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTK2Q05397 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTK2Q05397 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTK2Q05397 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTK2Q05397 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTK2Q05397 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTK2Q05397 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTK2Q05397 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PTK2Q05397 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PTK2Q05397 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTK2Q05397 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTK2Q05397 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTK2Q05397 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTK2Q05397 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTK2Q05397 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PTK2Q05397 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PTK2Q05397 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTK2Q05397 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTK2Q05397 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTK2Q05397 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTK2Q05397 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTK2Q05397 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTK2Q05397 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTK2Q05397 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTK2Q05397 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTK2Q05397 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTK2Q05397 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PTK2Q05397 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTK2Q05397 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTK2Q05397 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTK2Q05397 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTK2Q05397 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTK2Q05397 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTK2Q05397 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTK2Q05397 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTK2Q05397 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTK2Q05397 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PTK2Q05397 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PTK2Q05397 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTK2Q05397 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PTK2Q05397 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PTK2Q05397 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTK2Q05397 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTK2Q05397 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTK2Q05397 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PTK2Q05397 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTK2Q05397 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTK2Q05397 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTK2Q05397 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTK2Q05397 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTK2Q05397 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTK2Q05397 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTK2Q05397 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTK2Q05397 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTK2Q05397 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTK2Q05397 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTK2Q05397 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTK2Q05397 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTK2Q05397 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTK2Q05397 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTK2Q05397 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PTK2Q05397 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
PTK2Q05397 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTK2Q05397 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTK2Q05397 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTK2Q05397 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTK2Q05397 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTK2Q05397 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTK2Q05397 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTK2Q05397 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTK2Q05397 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTK2Q05397 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PTK2Q05397 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTK2Q05397 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTK2Q05397 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTK2Q05397 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTK2Q05397 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTK2Q05397 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTK2Q05397 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTK2Q05397 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTK2Q05397 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTK2Q05397 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTK2Q05397 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTK2Q05397 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTK2Q05397 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTK2Q05397 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PTK2Q05397 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTK2Q05397 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTK2Q05397 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PTK2Q05397 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTK2Q05397 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTK2Q05397 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms