Protein–RNA interactions for Protein: Q05048

CSTF1, Cleavage stimulation factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF1Q05048 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSTF1Q05048 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CSTF1Q05048 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSTF1Q05048 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSTF1Q05048 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSTF1Q05048 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CSTF1Q05048 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSTF1Q05048 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSTF1Q05048 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSTF1Q05048 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSTF1Q05048 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSTF1Q05048 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSTF1Q05048 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSTF1Q05048 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSTF1Q05048 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSTF1Q05048 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSTF1Q05048 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSTF1Q05048 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSTF1Q05048 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSTF1Q05048 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSTF1Q05048 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSTF1Q05048 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSTF1Q05048 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSTF1Q05048 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CSTF1Q05048 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSTF1Q05048 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSTF1Q05048 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSTF1Q05048 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSTF1Q05048 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSTF1Q05048 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CSTF1Q05048 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSTF1Q05048 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSTF1Q05048 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSTF1Q05048 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSTF1Q05048 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSTF1Q05048 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSTF1Q05048 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSTF1Q05048 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSTF1Q05048 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSTF1Q05048 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CSTF1Q05048 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CSTF1Q05048 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSTF1Q05048 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CSTF1Q05048 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSTF1Q05048 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSTF1Q05048 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSTF1Q05048 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSTF1Q05048 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSTF1Q05048 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSTF1Q05048 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSTF1Q05048 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSTF1Q05048 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSTF1Q05048 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSTF1Q05048 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CSTF1Q05048 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSTF1Q05048 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSTF1Q05048 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSTF1Q05048 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSTF1Q05048 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CSTF1Q05048 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSTF1Q05048 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSTF1Q05048 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CSTF1Q05048 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CSTF1Q05048 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CSTF1Q05048 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CSTF1Q05048 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CSTF1Q05048 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSTF1Q05048 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSTF1Q05048 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSTF1Q05048 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSTF1Q05048 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSTF1Q05048 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSTF1Q05048 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSTF1Q05048 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSTF1Q05048 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSTF1Q05048 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSTF1Q05048 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSTF1Q05048 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSTF1Q05048 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSTF1Q05048 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSTF1Q05048 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSTF1Q05048 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSTF1Q05048 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSTF1Q05048 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSTF1Q05048 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSTF1Q05048 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CSTF1Q05048 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSTF1Q05048 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSTF1Q05048 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CSTF1Q05048 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSTF1Q05048 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSTF1Q05048 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSTF1Q05048 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSTF1Q05048 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSTF1Q05048 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSTF1Q05048 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSTF1Q05048 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSTF1Q05048 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CSTF1Q05048 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CSTF1Q05048 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms