Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GBE1Q04446 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GBE1Q04446 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GBE1Q04446 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GBE1Q04446 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GBE1Q04446 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GBE1Q04446 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GBE1Q04446 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GBE1Q04446 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GBE1Q04446 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GBE1Q04446 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GBE1Q04446 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GBE1Q04446 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GBE1Q04446 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GBE1Q04446 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GBE1Q04446 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GBE1Q04446 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GBE1Q04446 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GBE1Q04446 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GBE1Q04446 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GBE1Q04446 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GBE1Q04446 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GBE1Q04446 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GBE1Q04446 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GBE1Q04446 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GBE1Q04446 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GBE1Q04446 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GBE1Q04446 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GBE1Q04446 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GBE1Q04446 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GBE1Q04446 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GBE1Q04446 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GBE1Q04446 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GBE1Q04446 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GBE1Q04446 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GBE1Q04446 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GBE1Q04446 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GBE1Q04446 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GBE1Q04446 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GBE1Q04446 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GBE1Q04446 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GBE1Q04446 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GBE1Q04446 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GBE1Q04446 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GBE1Q04446 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GBE1Q04446 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GBE1Q04446 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GBE1Q04446 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GBE1Q04446 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GBE1Q04446 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GBE1Q04446 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GBE1Q04446 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GBE1Q04446 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GBE1Q04446 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GBE1Q04446 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GBE1Q04446 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GBE1Q04446 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GBE1Q04446 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GBE1Q04446 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GBE1Q04446 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GBE1Q04446 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GBE1Q04446 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GBE1Q04446 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GBE1Q04446 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GBE1Q04446 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GBE1Q04446 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GBE1Q04446 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GBE1Q04446 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GBE1Q04446 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GBE1Q04446 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GBE1Q04446 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GBE1Q04446 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GBE1Q04446 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GBE1Q04446 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GBE1Q04446 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GBE1Q04446 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GBE1Q04446 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GBE1Q04446 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GBE1Q04446 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GBE1Q04446 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GBE1Q04446 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GBE1Q04446 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GBE1Q04446 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GBE1Q04446 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GBE1Q04446 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GBE1Q04446 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GBE1Q04446 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GBE1Q04446 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GBE1Q04446 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GBE1Q04446 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GBE1Q04446 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GBE1Q04446 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GBE1Q04446 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GBE1Q04446 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GBE1Q04446 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GBE1Q04446 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GBE1Q04446 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GBE1Q04446 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GBE1Q04446 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GBE1Q04446 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms