Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFRSF17Q02223 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF17Q02223 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF17Q02223 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF17Q02223 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF17Q02223 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF17Q02223 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF17Q02223 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF17Q02223 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF17Q02223 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF17Q02223 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF17Q02223 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF17Q02223 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF17Q02223 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF17Q02223 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFRSF17Q02223 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFRSF17Q02223 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFRSF17Q02223 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFRSF17Q02223 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFRSF17Q02223 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFRSF17Q02223 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFRSF17Q02223 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFRSF17Q02223 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFRSF17Q02223 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFRSF17Q02223 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFRSF17Q02223 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFRSF17Q02223 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFRSF17Q02223 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFRSF17Q02223 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFRSF17Q02223 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFRSF17Q02223 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFRSF17Q02223 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFRSF17Q02223 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFRSF17Q02223 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFRSF17Q02223 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFRSF17Q02223 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFRSF17Q02223 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFRSF17Q02223 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFRSF17Q02223 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFRSF17Q02223 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFRSF17Q02223 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFRSF17Q02223 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFRSF17Q02223 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFRSF17Q02223 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFRSF17Q02223 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFRSF17Q02223 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFRSF17Q02223 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFRSF17Q02223 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFRSF17Q02223 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFRSF17Q02223 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFRSF17Q02223 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFRSF17Q02223 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFRSF17Q02223 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFRSF17Q02223 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFRSF17Q02223 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFRSF17Q02223 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFRSF17Q02223 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFRSF17Q02223 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFRSF17Q02223 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFRSF17Q02223 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFRSF17Q02223 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFRSF17Q02223 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFRSF17Q02223 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF17Q02223 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF17Q02223 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF17Q02223 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF17Q02223 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF17Q02223 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF17Q02223 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF17Q02223 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF17Q02223 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF17Q02223 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF17Q02223 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF17Q02223 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF17Q02223 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFRSF17Q02223 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFRSF17Q02223 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFRSF17Q02223 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFRSF17Q02223 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFRSF17Q02223 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFRSF17Q02223 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFRSF17Q02223 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFRSF17Q02223 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFRSF17Q02223 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFRSF17Q02223 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFRSF17Q02223 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFRSF17Q02223 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFRSF17Q02223 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFRSF17Q02223 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFRSF17Q02223 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFRSF17Q02223 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFRSF17Q02223 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFRSF17Q02223 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFRSF17Q02223 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFRSF17Q02223 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFRSF17Q02223 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFRSF17Q02223 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFRSF17Q02223 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFRSF17Q02223 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFRSF17Q02223 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms