Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PLCB3Q01970 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PLCB3Q01970 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PLCB3Q01970 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PLCB3Q01970 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PLCB3Q01970 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PLCB3Q01970 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PLCB3Q01970 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PLCB3Q01970 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PLCB3Q01970 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PLCB3Q01970 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PLCB3Q01970 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PLCB3Q01970 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PLCB3Q01970 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PLCB3Q01970 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PLCB3Q01970 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PLCB3Q01970 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PLCB3Q01970 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PLCB3Q01970 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PLCB3Q01970 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PLCB3Q01970 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PLCB3Q01970 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PLCB3Q01970 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PLCB3Q01970 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PLCB3Q01970 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PLCB3Q01970 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PLCB3Q01970 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PLCB3Q01970 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PLCB3Q01970 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PLCB3Q01970 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PLCB3Q01970 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PLCB3Q01970 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PLCB3Q01970 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PLCB3Q01970 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PLCB3Q01970 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PLCB3Q01970 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PLCB3Q01970 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PLCB3Q01970 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PLCB3Q01970 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PLCB3Q01970 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PLCB3Q01970 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PLCB3Q01970 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PLCB3Q01970 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PLCB3Q01970 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PLCB3Q01970 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PLCB3Q01970 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PLCB3Q01970 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PLCB3Q01970 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PLCB3Q01970 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PLCB3Q01970 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PLCB3Q01970 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PLCB3Q01970 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PLCB3Q01970 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PLCB3Q01970 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PLCB3Q01970 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PLCB3Q01970 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PLCB3Q01970 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PLCB3Q01970 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PLCB3Q01970 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PLCB3Q01970 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PLCB3Q01970 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PLCB3Q01970 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PLCB3Q01970 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PLCB3Q01970 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PLCB3Q01970 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PLCB3Q01970 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PLCB3Q01970 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PLCB3Q01970 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PLCB3Q01970 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PLCB3Q01970 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PLCB3Q01970 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PLCB3Q01970 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PLCB3Q01970 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PLCB3Q01970 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PLCB3Q01970 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PLCB3Q01970 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PLCB3Q01970 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PLCB3Q01970 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PLCB3Q01970 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PLCB3Q01970 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PLCB3Q01970 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PLCB3Q01970 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PLCB3Q01970 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PLCB3Q01970 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PLCB3Q01970 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PLCB3Q01970 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PLCB3Q01970 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PLCB3Q01970 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PLCB3Q01970 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PLCB3Q01970 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PLCB3Q01970 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PLCB3Q01970 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PLCB3Q01970 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PLCB3Q01970 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PLCB3Q01970 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PLCB3Q01970 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PLCB3Q01970 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PLCB3Q01970 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PLCB3Q01970 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PLCB3Q01970 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms