Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC6A3Q01959 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC6A3Q01959 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC6A3Q01959 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC6A3Q01959 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC6A3Q01959 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC6A3Q01959 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC6A3Q01959 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC6A3Q01959 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC6A3Q01959 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC6A3Q01959 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC6A3Q01959 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC6A3Q01959 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC6A3Q01959 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC6A3Q01959 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC6A3Q01959 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC6A3Q01959 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC6A3Q01959 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC6A3Q01959 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC6A3Q01959 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC6A3Q01959 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC6A3Q01959 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC6A3Q01959 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC6A3Q01959 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC6A3Q01959 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC6A3Q01959 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC6A3Q01959 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC6A3Q01959 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC6A3Q01959 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC6A3Q01959 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC6A3Q01959 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC6A3Q01959 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC6A3Q01959 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC6A3Q01959 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC6A3Q01959 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC6A3Q01959 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC6A3Q01959 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC6A3Q01959 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC6A3Q01959 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC6A3Q01959 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC6A3Q01959 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC6A3Q01959 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SLC6A3Q01959 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC6A3Q01959 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC6A3Q01959 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC6A3Q01959 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC6A3Q01959 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC6A3Q01959 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC6A3Q01959 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC6A3Q01959 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC6A3Q01959 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC6A3Q01959 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC6A3Q01959 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC6A3Q01959 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC6A3Q01959 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC6A3Q01959 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC6A3Q01959 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC6A3Q01959 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC6A3Q01959 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC6A3Q01959 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC6A3Q01959 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC6A3Q01959 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC6A3Q01959 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC6A3Q01959 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC6A3Q01959 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC6A3Q01959 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC6A3Q01959 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC6A3Q01959 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC6A3Q01959 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC6A3Q01959 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC6A3Q01959 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC6A3Q01959 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC6A3Q01959 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC6A3Q01959 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC6A3Q01959 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC6A3Q01959 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC6A3Q01959 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC6A3Q01959 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC6A3Q01959 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC6A3Q01959 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC6A3Q01959 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC6A3Q01959 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC6A3Q01959 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC6A3Q01959 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC6A3Q01959 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC6A3Q01959 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC6A3Q01959 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC6A3Q01959 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC6A3Q01959 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC6A3Q01959 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC6A3Q01959 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC6A3Q01959 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC6A3Q01959 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC6A3Q01959 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC6A3Q01959 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC6A3Q01959 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC6A3Q01959 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC6A3Q01959 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SLC6A3Q01959 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SLC6A3Q01959 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms