Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRCDQ00LT1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRCDQ00LT1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRCDQ00LT1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRCDQ00LT1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRCDQ00LT1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRCDQ00LT1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PRCDQ00LT1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PRCDQ00LT1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PRCDQ00LT1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PRCDQ00LT1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PRCDQ00LT1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PRCDQ00LT1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PRCDQ00LT1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PRCDQ00LT1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PRCDQ00LT1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PRCDQ00LT1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PRCDQ00LT1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PRCDQ00LT1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PRCDQ00LT1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PRCDQ00LT1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRCDQ00LT1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRCDQ00LT1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRCDQ00LT1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRCDQ00LT1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRCDQ00LT1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PRCDQ00LT1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PRCDQ00LT1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PRCDQ00LT1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PRCDQ00LT1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PRCDQ00LT1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PRCDQ00LT1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PRCDQ00LT1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PRCDQ00LT1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PRCDQ00LT1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PRCDQ00LT1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PRCDQ00LT1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PRCDQ00LT1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PRCDQ00LT1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PRCDQ00LT1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PRCDQ00LT1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PRCDQ00LT1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PRCDQ00LT1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PRCDQ00LT1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PRCDQ00LT1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PRCDQ00LT1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PRCDQ00LT1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PRCDQ00LT1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PRCDQ00LT1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PRCDQ00LT1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PRCDQ00LT1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PRCDQ00LT1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PRCDQ00LT1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PRCDQ00LT1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PRCDQ00LT1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PRCDQ00LT1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRCDQ00LT1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRCDQ00LT1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRCDQ00LT1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRCDQ00LT1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRCDQ00LT1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRCDQ00LT1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRCDQ00LT1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PRCDQ00LT1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PRCDQ00LT1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PRCDQ00LT1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PRCDQ00LT1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRCDQ00LT1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PRCDQ00LT1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRCDQ00LT1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRCDQ00LT1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRCDQ00LT1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRCDQ00LT1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRCDQ00LT1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRCDQ00LT1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRCDQ00LT1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRCDQ00LT1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRCDQ00LT1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRCDQ00LT1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRCDQ00LT1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRCDQ00LT1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRCDQ00LT1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRCDQ00LT1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRCDQ00LT1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRCDQ00LT1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRCDQ00LT1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRCDQ00LT1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRCDQ00LT1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRCDQ00LT1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRCDQ00LT1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRCDQ00LT1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRCDQ00LT1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRCDQ00LT1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRCDQ00LT1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRCDQ00LT1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRCDQ00LT1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRCDQ00LT1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRCDQ00LT1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRCDQ00LT1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRCDQ00LT1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms