Protein–RNA interactions for Protein: Q00722

PLCB2, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB2Q00722 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PLCB2Q00722 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PLCB2Q00722 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PLCB2Q00722 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PLCB2Q00722 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PLCB2Q00722 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PLCB2Q00722 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PLCB2Q00722 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PLCB2Q00722 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PLCB2Q00722 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PLCB2Q00722 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PLCB2Q00722 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PLCB2Q00722 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PLCB2Q00722 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PLCB2Q00722 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PLCB2Q00722 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PLCB2Q00722 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PLCB2Q00722 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PLCB2Q00722 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PLCB2Q00722 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PLCB2Q00722 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PLCB2Q00722 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PLCB2Q00722 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PLCB2Q00722 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PLCB2Q00722 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PLCB2Q00722 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PLCB2Q00722 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PLCB2Q00722 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PLCB2Q00722 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PLCB2Q00722 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PLCB2Q00722 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PLCB2Q00722 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PLCB2Q00722 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PLCB2Q00722 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PLCB2Q00722 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PLCB2Q00722 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PLCB2Q00722 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PLCB2Q00722 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PLCB2Q00722 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PLCB2Q00722 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PLCB2Q00722 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PLCB2Q00722 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PLCB2Q00722 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PLCB2Q00722 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PLCB2Q00722 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PLCB2Q00722 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PLCB2Q00722 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PLCB2Q00722 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PLCB2Q00722 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PLCB2Q00722 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PLCB2Q00722 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PLCB2Q00722 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PLCB2Q00722 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PLCB2Q00722 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PLCB2Q00722 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PLCB2Q00722 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PLCB2Q00722 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PLCB2Q00722 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PLCB2Q00722 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PLCB2Q00722 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PLCB2Q00722 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PLCB2Q00722 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PLCB2Q00722 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PLCB2Q00722 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PLCB2Q00722 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PLCB2Q00722 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PLCB2Q00722 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PLCB2Q00722 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PLCB2Q00722 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PLCB2Q00722 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PLCB2Q00722 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PLCB2Q00722 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PLCB2Q00722 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PLCB2Q00722 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PLCB2Q00722 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PLCB2Q00722 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PLCB2Q00722 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PLCB2Q00722 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PLCB2Q00722 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLCB2Q00722 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLCB2Q00722 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PLCB2Q00722 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PLCB2Q00722 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PLCB2Q00722 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PLCB2Q00722 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PLCB2Q00722 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PLCB2Q00722 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PLCB2Q00722 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PLCB2Q00722 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PLCB2Q00722 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PLCB2Q00722 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
PLCB2Q00722 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PLCB2Q00722 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PLCB2Q00722 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PLCB2Q00722 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PLCB2Q00722 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PLCB2Q00722 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PLCB2Q00722 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PLCB2Q00722 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PLCB2Q00722 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms