Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM3AP98173 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM3AP98173 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM3AP98173 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM3AP98173 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM3AP98173 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM3AP98173 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM3AP98173 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM3AP98173 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM3AP98173 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM3AP98173 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM3AP98173 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM3AP98173 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM3AP98173 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM3AP98173 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM3AP98173 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM3AP98173 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM3AP98173 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM3AP98173 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM3AP98173 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM3AP98173 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM3AP98173 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM3AP98173 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM3AP98173 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM3AP98173 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM3AP98173 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM3AP98173 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM3AP98173 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM3AP98173 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM3AP98173 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM3AP98173 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM3AP98173 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM3AP98173 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM3AP98173 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM3AP98173 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM3AP98173 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM3AP98173 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM3AP98173 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM3AP98173 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM3AP98173 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM3AP98173 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM3AP98173 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM3AP98173 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM3AP98173 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM3AP98173 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM3AP98173 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM3AP98173 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FAM3AP98173 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM3AP98173 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM3AP98173 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM3AP98173 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM3AP98173 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM3AP98173 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM3AP98173 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM3AP98173 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM3AP98173 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM3AP98173 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM3AP98173 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM3AP98173 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FAM3AP98173 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM3AP98173 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM3AP98173 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM3AP98173 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FAM3AP98173 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM3AP98173 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM3AP98173 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM3AP98173 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM3AP98173 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM3AP98173 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM3AP98173 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM3AP98173 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM3AP98173 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FAM3AP98173 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM3AP98173 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM3AP98173 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM3AP98173 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM3AP98173 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM3AP98173 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM3AP98173 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FAM3AP98173 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM3AP98173 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM3AP98173 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM3AP98173 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM3AP98173 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM3AP98173 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM3AP98173 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM3AP98173 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM3AP98173 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM3AP98173 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM3AP98173 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM3AP98173 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM3AP98173 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM3AP98173 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM3AP98173 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM3AP98173 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM3AP98173 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM3AP98173 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM3AP98173 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM3AP98173 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM3AP98173 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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