Protein–RNA interactions for Protein: P78395

PRAME, Melanoma antigen preferentially expressed in tumors, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEP78395 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRAMEP78395 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRAMEP78395 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PRAMEP78395 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRAMEP78395 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRAMEP78395 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEP78395 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEP78395 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEP78395 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEP78395 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRAMEP78395 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRAMEP78395 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRAMEP78395 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRAMEP78395 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRAMEP78395 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRAMEP78395 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRAMEP78395 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRAMEP78395 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRAMEP78395 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PRAMEP78395 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRAMEP78395 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRAMEP78395 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRAMEP78395 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEP78395 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEP78395 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEP78395 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEP78395 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEP78395 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEP78395 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEP78395 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRAMEP78395 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRAMEP78395 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRAMEP78395 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRAMEP78395 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRAMEP78395 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRAMEP78395 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRAMEP78395 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRAMEP78395 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRAMEP78395 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRAMEP78395 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRAMEP78395 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRAMEP78395 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRAMEP78395 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRAMEP78395 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRAMEP78395 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRAMEP78395 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRAMEP78395 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRAMEP78395 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRAMEP78395 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEP78395 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEP78395 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEP78395 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEP78395 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEP78395 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAMEP78395 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAMEP78395 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAMEP78395 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAMEP78395 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAMEP78395 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAMEP78395 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAMEP78395 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAMEP78395 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAMEP78395 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAMEP78395 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAMEP78395 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAMEP78395 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAMEP78395 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAMEP78395 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAMEP78395 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAMEP78395 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAMEP78395 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAMEP78395 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAMEP78395 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAMEP78395 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAMEP78395 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAMEP78395 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRAMEP78395 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRAMEP78395 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRAMEP78395 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRAMEP78395 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAMEP78395 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAMEP78395 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAMEP78395 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRAMEP78395 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRAMEP78395 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRAMEP78395 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRAMEP78395 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRAMEP78395 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRAMEP78395 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAMEP78395 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAMEP78395 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAMEP78395 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAMEP78395 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAMEP78395 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAMEP78395 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAMEP78395 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEP78395 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEP78395 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEP78395 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEP78395 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms