Protein–RNA interactions for Protein: P78386

KRT85, Keratin, type II cuticular Hb5, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT85P78386 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT85P78386 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT85P78386 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT85P78386 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT85P78386 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT85P78386 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT85P78386 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT85P78386 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT85P78386 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT85P78386 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT85P78386 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT85P78386 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT85P78386 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KRT85P78386 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KRT85P78386 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KRT85P78386 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KRT85P78386 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KRT85P78386 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
KRT85P78386 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
KRT85P78386 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT85P78386 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT85P78386 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KRT85P78386 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KRT85P78386 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KRT85P78386 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
KRT85P78386 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KRT85P78386 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KRT85P78386 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KRT85P78386 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KRT85P78386 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KRT85P78386 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KRT85P78386 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KRT85P78386 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KRT85P78386 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT85P78386 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT85P78386 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT85P78386 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT85P78386 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT85P78386 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT85P78386 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT85P78386 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT85P78386 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT85P78386 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT85P78386 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT85P78386 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT85P78386 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KRT85P78386 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KRT85P78386 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KRT85P78386 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KRT85P78386 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KRT85P78386 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
KRT85P78386 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT85P78386 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT85P78386 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT85P78386 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT85P78386 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KRT85P78386 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KRT85P78386 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KRT85P78386 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KRT85P78386 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
KRT85P78386 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KRT85P78386 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KRT85P78386 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KRT85P78386 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KRT85P78386 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRT85P78386 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRT85P78386 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRT85P78386 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRT85P78386 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KRT85P78386 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KRT85P78386 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KRT85P78386 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KRT85P78386 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KRT85P78386 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KRT85P78386 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT85P78386 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT85P78386 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT85P78386 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT85P78386 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT85P78386 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT85P78386 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT85P78386 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT85P78386 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KRT85P78386 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KRT85P78386 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KRT85P78386 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KRT85P78386 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KRT85P78386 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KRT85P78386 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KRT85P78386 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KRT85P78386 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KRT85P78386 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KRT85P78386 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KRT85P78386 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KRT85P78386 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KRT85P78386 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
KRT85P78386 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
KRT85P78386 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
KRT85P78386 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
KRT85P78386 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms