Protein–RNA interactions for Protein: P62753

RPS6, 40S ribosomal protein S6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6P62753 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RPS6P62753 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RPS6P62753 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RPS6P62753 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RPS6P62753 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RPS6P62753 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
RPS6P62753 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RPS6P62753 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RPS6P62753 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RPS6P62753 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
RPS6P62753 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RPS6P62753 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
RPS6P62753 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RPS6P62753 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RPS6P62753 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPS6P62753 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
RPS6P62753 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
RPS6P62753 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPS6P62753 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
RPS6P62753 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPS6P62753 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RPS6P62753 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RPS6P62753 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RPS6P62753 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RPS6P62753 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RPS6P62753 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RPS6P62753 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RPS6P62753 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RPS6P62753 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RPS6P62753 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RPS6P62753 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RPS6P62753 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RPS6P62753 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RPS6P62753 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RPS6P62753 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RPS6P62753 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
RPS6P62753 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RPS6P62753 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RPS6P62753 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RPS6P62753 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RPS6P62753 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RPS6P62753 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RPS6P62753 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RPS6P62753 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RPS6P62753 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPS6P62753 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPS6P62753 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPS6P62753 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPS6P62753 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPS6P62753 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPS6P62753 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPS6P62753 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RPS6P62753 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RPS6P62753 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RPS6P62753 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RPS6P62753 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RPS6P62753 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RPS6P62753 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RPS6P62753 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RPS6P62753 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPS6P62753 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPS6P62753 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPS6P62753 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPS6P62753 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPS6P62753 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPS6P62753 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
RPS6P62753 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
RPS6P62753 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RPS6P62753 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RPS6P62753 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RPS6P62753 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RPS6P62753 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RPS6P62753 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RPS6P62753 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RPS6P62753 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RPS6P62753 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPS6P62753 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPS6P62753 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPS6P62753 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPS6P62753 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPS6P62753 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPS6P62753 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPS6P62753 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPS6P62753 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPS6P62753 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPS6P62753 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPS6P62753 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RPS6P62753 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPS6P62753 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPS6P62753 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPS6P62753 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPS6P62753 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPS6P62753 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPS6P62753 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPS6P62753 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
RPS6P62753 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPS6P62753 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPS6P62753 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPS6P62753 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPS6P62753 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms