Protein–RNA interactions for Protein: P62277

RPS13, 40S ribosomal protein S13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS13P62277 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS13P62277 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS13P62277 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS13P62277 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS13P62277 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS13P62277 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS13P62277 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPS13P62277 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPS13P62277 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPS13P62277 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS13P62277 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS13P62277 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS13P62277 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS13P62277 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS13P62277 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS13P62277 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS13P62277 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS13P62277 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS13P62277 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS13P62277 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPS13P62277 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPS13P62277 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPS13P62277 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPS13P62277 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPS13P62277 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPS13P62277 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPS13P62277 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPS13P62277 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS13P62277 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS13P62277 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS13P62277 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS13P62277 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS13P62277 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS13P62277 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS13P62277 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS13P62277 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS13P62277 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS13P62277 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS13P62277 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS13P62277 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS13P62277 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS13P62277 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS13P62277 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS13P62277 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS13P62277 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS13P62277 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS13P62277 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS13P62277 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS13P62277 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS13P62277 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS13P62277 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS13P62277 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS13P62277 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS13P62277 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS13P62277 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS13P62277 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS13P62277 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS13P62277 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPS13P62277 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPS13P62277 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPS13P62277 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPS13P62277 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPS13P62277 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS13P62277 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS13P62277 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS13P62277 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS13P62277 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS13P62277 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS13P62277 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS13P62277 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS13P62277 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS13P62277 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS13P62277 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS13P62277 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS13P62277 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS13P62277 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS13P62277 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS13P62277 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS13P62277 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS13P62277 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS13P62277 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS13P62277 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS13P62277 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS13P62277 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS13P62277 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS13P62277 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS13P62277 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS13P62277 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS13P62277 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS13P62277 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS13P62277 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS13P62277 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS13P62277 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS13P62277 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS13P62277 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS13P62277 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS13P62277 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS13P62277 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS13P62277 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS13P62277 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms