Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SNAP25P60880 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SNAP25P60880 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SNAP25P60880 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SNAP25P60880 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SNAP25P60880 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SNAP25P60880 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SNAP25P60880 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SNAP25P60880 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SNAP25P60880 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SNAP25P60880 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SNAP25P60880 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SNAP25P60880 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SNAP25P60880 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SNAP25P60880 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SNAP25P60880 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SNAP25P60880 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SNAP25P60880 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SNAP25P60880 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SNAP25P60880 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SNAP25P60880 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SNAP25P60880 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SNAP25P60880 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SNAP25P60880 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SNAP25P60880 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SNAP25P60880 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SNAP25P60880 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SNAP25P60880 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SNAP25P60880 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SNAP25P60880 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SNAP25P60880 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SNAP25P60880 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SNAP25P60880 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SNAP25P60880 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SNAP25P60880 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SNAP25P60880 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SNAP25P60880 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SNAP25P60880 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SNAP25P60880 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SNAP25P60880 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SNAP25P60880 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SNAP25P60880 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SNAP25P60880 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SNAP25P60880 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SNAP25P60880 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SNAP25P60880 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SNAP25P60880 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SNAP25P60880 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SNAP25P60880 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SNAP25P60880 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SNAP25P60880 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SNAP25P60880 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SNAP25P60880 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SNAP25P60880 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SNAP25P60880 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SNAP25P60880 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SNAP25P60880 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SNAP25P60880 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SNAP25P60880 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SNAP25P60880 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SNAP25P60880 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SNAP25P60880 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SNAP25P60880 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SNAP25P60880 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SNAP25P60880 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SNAP25P60880 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SNAP25P60880 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SNAP25P60880 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SNAP25P60880 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SNAP25P60880 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SNAP25P60880 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SNAP25P60880 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SNAP25P60880 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SNAP25P60880 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SNAP25P60880 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SNAP25P60880 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SNAP25P60880 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SNAP25P60880 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SNAP25P60880 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SNAP25P60880 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SNAP25P60880 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SNAP25P60880 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SNAP25P60880 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SNAP25P60880 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SNAP25P60880 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SNAP25P60880 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SNAP25P60880 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SNAP25P60880 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SNAP25P60880 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SNAP25P60880 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SNAP25P60880 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SNAP25P60880 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SNAP25P60880 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SNAP25P60880 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SNAP25P60880 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SNAP25P60880 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SNAP25P60880 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SNAP25P60880 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SNAP25P60880 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SNAP25P60880 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms