Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVFC1P60507 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVFC1P60507 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVFC1P60507 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVFC1P60507 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVFC1P60507 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERVFC1P60507 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERVFC1P60507 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERVFC1P60507 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ERVFC1P60507 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERVFC1P60507 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERVFC1P60507 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERVFC1P60507 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ERVFC1P60507 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERVFC1P60507 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ERVFC1P60507 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERVFC1P60507 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERVFC1P60507 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ERVFC1P60507 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERVFC1P60507 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ERVFC1P60507 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERVFC1P60507 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERVFC1P60507 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERVFC1P60507 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERVFC1P60507 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERVFC1P60507 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERVFC1P60507 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERVFC1P60507 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ERVFC1P60507 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERVFC1P60507 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERVFC1P60507 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERVFC1P60507 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERVFC1P60507 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERVFC1P60507 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERVFC1P60507 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ERVFC1P60507 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERVFC1P60507 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERVFC1P60507 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERVFC1P60507 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERVFC1P60507 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERVFC1P60507 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERVFC1P60507 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERVFC1P60507 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ERVFC1P60507 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERVFC1P60507 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERVFC1P60507 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERVFC1P60507 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERVFC1P60507 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERVFC1P60507 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERVFC1P60507 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERVFC1P60507 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERVFC1P60507 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERVFC1P60507 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ERVFC1P60507 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ERVFC1P60507 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERVFC1P60507 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERVFC1P60507 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERVFC1P60507 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ERVFC1P60507 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERVFC1P60507 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERVFC1P60507 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERVFC1P60507 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERVFC1P60507 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERVFC1P60507 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERVFC1P60507 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVFC1P60507 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVFC1P60507 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVFC1P60507 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVFC1P60507 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVFC1P60507 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVFC1P60507 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERVFC1P60507 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERVFC1P60507 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERVFC1P60507 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERVFC1P60507 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERVFC1P60507 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERVFC1P60507 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERVFC1P60507 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERVFC1P60507 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERVFC1P60507 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ERVFC1P60507 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERVFC1P60507 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERVFC1P60507 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERVFC1P60507 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERVFC1P60507 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERVFC1P60507 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ERVFC1P60507 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERVFC1P60507 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERVFC1P60507 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERVFC1P60507 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERVFC1P60507 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERVFC1P60507 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERVFC1P60507 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERVFC1P60507 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERVFC1P60507 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ERVFC1P60507 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ERVFC1P60507 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ERVFC1P60507 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERVFC1P60507 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERVFC1P60507 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms