Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LOXL3P58215 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LOXL3P58215 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LOXL3P58215 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LOXL3P58215 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LOXL3P58215 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LOXL3P58215 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LOXL3P58215 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LOXL3P58215 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LOXL3P58215 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LOXL3P58215 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LOXL3P58215 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LOXL3P58215 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LOXL3P58215 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LOXL3P58215 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LOXL3P58215 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LOXL3P58215 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LOXL3P58215 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LOXL3P58215 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LOXL3P58215 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LOXL3P58215 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LOXL3P58215 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LOXL3P58215 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LOXL3P58215 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LOXL3P58215 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LOXL3P58215 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LOXL3P58215 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LOXL3P58215 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LOXL3P58215 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LOXL3P58215 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LOXL3P58215 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LOXL3P58215 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LOXL3P58215 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LOXL3P58215 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LOXL3P58215 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LOXL3P58215 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LOXL3P58215 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LOXL3P58215 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LOXL3P58215 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LOXL3P58215 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LOXL3P58215 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LOXL3P58215 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LOXL3P58215 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LOXL3P58215 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LOXL3P58215 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LOXL3P58215 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LOXL3P58215 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LOXL3P58215 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LOXL3P58215 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LOXL3P58215 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LOXL3P58215 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LOXL3P58215 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LOXL3P58215 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LOXL3P58215 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LOXL3P58215 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LOXL3P58215 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LOXL3P58215 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LOXL3P58215 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LOXL3P58215 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LOXL3P58215 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LOXL3P58215 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LOXL3P58215 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LOXL3P58215 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LOXL3P58215 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LOXL3P58215 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LOXL3P58215 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LOXL3P58215 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LOXL3P58215 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LOXL3P58215 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LOXL3P58215 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LOXL3P58215 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LOXL3P58215 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LOXL3P58215 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LOXL3P58215 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LOXL3P58215 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LOXL3P58215 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LOXL3P58215 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LOXL3P58215 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LOXL3P58215 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LOXL3P58215 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LOXL3P58215 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
LOXL3P58215 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LOXL3P58215 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LOXL3P58215 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LOXL3P58215 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LOXL3P58215 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LOXL3P58215 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LOXL3P58215 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LOXL3P58215 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
LOXL3P58215 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LOXL3P58215 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LOXL3P58215 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LOXL3P58215 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LOXL3P58215 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LOXL3P58215 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LOXL3P58215 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LOXL3P58215 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LOXL3P58215 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LOXL3P58215 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LOXL3P58215 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms