Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB25P57735 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB25P57735 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB25P57735 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB25P57735 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB25P57735 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB25P57735 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB25P57735 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB25P57735 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB25P57735 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB25P57735 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB25P57735 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB25P57735 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB25P57735 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB25P57735 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB25P57735 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB25P57735 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB25P57735 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB25P57735 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB25P57735 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB25P57735 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB25P57735 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB25P57735 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB25P57735 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB25P57735 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB25P57735 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB25P57735 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB25P57735 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB25P57735 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB25P57735 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB25P57735 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB25P57735 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB25P57735 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB25P57735 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB25P57735 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB25P57735 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB25P57735 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB25P57735 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RAB25P57735 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAB25P57735 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAB25P57735 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB25P57735 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB25P57735 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB25P57735 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB25P57735 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RAB25P57735 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB25P57735 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB25P57735 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RAB25P57735 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB25P57735 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB25P57735 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB25P57735 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB25P57735 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RAB25P57735 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB25P57735 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB25P57735 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB25P57735 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB25P57735 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB25P57735 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB25P57735 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB25P57735 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB25P57735 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB25P57735 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB25P57735 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB25P57735 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB25P57735 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB25P57735 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB25P57735 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB25P57735 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB25P57735 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB25P57735 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB25P57735 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RAB25P57735 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RAB25P57735 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB25P57735 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB25P57735 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB25P57735 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB25P57735 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB25P57735 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB25P57735 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB25P57735 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB25P57735 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB25P57735 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB25P57735 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB25P57735 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB25P57735 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB25P57735 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB25P57735 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB25P57735 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB25P57735 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB25P57735 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB25P57735 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB25P57735 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB25P57735 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB25P57735 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB25P57735 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB25P57735 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB25P57735 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB25P57735 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB25P57735 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms