Protein–RNA interactions for Protein: P56750

CLDN17, Claudin-17, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN17P56750 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN17P56750 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN17P56750 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN17P56750 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN17P56750 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN17P56750 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN17P56750 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN17P56750 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLDN17P56750 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN17P56750 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN17P56750 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN17P56750 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN17P56750 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN17P56750 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN17P56750 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN17P56750 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN17P56750 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN17P56750 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN17P56750 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN17P56750 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN17P56750 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN17P56750 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN17P56750 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN17P56750 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN17P56750 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN17P56750 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN17P56750 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN17P56750 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN17P56750 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN17P56750 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN17P56750 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN17P56750 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN17P56750 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN17P56750 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN17P56750 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN17P56750 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN17P56750 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN17P56750 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN17P56750 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN17P56750 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN17P56750 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN17P56750 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN17P56750 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN17P56750 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN17P56750 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN17P56750 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN17P56750 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN17P56750 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN17P56750 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN17P56750 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN17P56750 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN17P56750 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN17P56750 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN17P56750 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN17P56750 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN17P56750 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN17P56750 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN17P56750 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN17P56750 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN17P56750 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN17P56750 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN17P56750 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN17P56750 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN17P56750 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN17P56750 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN17P56750 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN17P56750 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN17P56750 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN17P56750 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN17P56750 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN17P56750 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN17P56750 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN17P56750 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN17P56750 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN17P56750 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN17P56750 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN17P56750 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN17P56750 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CLDN17P56750 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN17P56750 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN17P56750 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN17P56750 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN17P56750 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN17P56750 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN17P56750 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN17P56750 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN17P56750 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN17P56750 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN17P56750 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN17P56750 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN17P56750 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN17P56750 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN17P56750 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN17P56750 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN17P56750 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN17P56750 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN17P56750 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN17P56750 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN17P56750 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN17P56750 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms