Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLTPP55058 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLTPP55058 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLTPP55058 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLTPP55058 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLTPP55058 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLTPP55058 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLTPP55058 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLTPP55058 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLTPP55058 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLTPP55058 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLTPP55058 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLTPP55058 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLTPP55058 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLTPP55058 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLTPP55058 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PLTPP55058 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PLTPP55058 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PLTPP55058 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PLTPP55058 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLTPP55058 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLTPP55058 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLTPP55058 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PLTPP55058 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PLTPP55058 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLTPP55058 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLTPP55058 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLTPP55058 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLTPP55058 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLTPP55058 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLTPP55058 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLTPP55058 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLTPP55058 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLTPP55058 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLTPP55058 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PLTPP55058 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLTPP55058 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PLTPP55058 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLTPP55058 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLTPP55058 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLTPP55058 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLTPP55058 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLTPP55058 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLTPP55058 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PLTPP55058 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLTPP55058 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLTPP55058 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLTPP55058 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLTPP55058 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLTPP55058 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLTPP55058 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLTPP55058 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLTPP55058 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLTPP55058 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLTPP55058 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLTPP55058 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLTPP55058 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLTPP55058 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLTPP55058 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PLTPP55058 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLTPP55058 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLTPP55058 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLTPP55058 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLTPP55058 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLTPP55058 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLTPP55058 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLTPP55058 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLTPP55058 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLTPP55058 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLTPP55058 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLTPP55058 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLTPP55058 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLTPP55058 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLTPP55058 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLTPP55058 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLTPP55058 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLTPP55058 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLTPP55058 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLTPP55058 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLTPP55058 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLTPP55058 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLTPP55058 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLTPP55058 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLTPP55058 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLTPP55058 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLTPP55058 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLTPP55058 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLTPP55058 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLTPP55058 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLTPP55058 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLTPP55058 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PLTPP55058 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLTPP55058 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLTPP55058 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLTPP55058 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLTPP55058 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLTPP55058 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLTPP55058 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLTPP55058 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLTPP55058 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms