Protein–RNA interactions for Protein: P54252

ATXN3, Ataxin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3P54252 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATXN3P54252 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATXN3P54252 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATXN3P54252 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATXN3P54252 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ATXN3P54252 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATXN3P54252 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATXN3P54252 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATXN3P54252 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ATXN3P54252 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATXN3P54252 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATXN3P54252 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATXN3P54252 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATXN3P54252 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATXN3P54252 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATXN3P54252 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ATXN3P54252 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATXN3P54252 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATXN3P54252 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATXN3P54252 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATXN3P54252 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATXN3P54252 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATXN3P54252 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATXN3P54252 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATXN3P54252 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATXN3P54252 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATXN3P54252 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATXN3P54252 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATXN3P54252 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATXN3P54252 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATXN3P54252 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATXN3P54252 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATXN3P54252 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATXN3P54252 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATXN3P54252 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ATXN3P54252 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATXN3P54252 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATXN3P54252 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATXN3P54252 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ATXN3P54252 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATXN3P54252 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATXN3P54252 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATXN3P54252 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATXN3P54252 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATXN3P54252 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATXN3P54252 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATXN3P54252 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATXN3P54252 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATXN3P54252 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATXN3P54252 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATXN3P54252 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ATXN3P54252 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATXN3P54252 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATXN3P54252 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATXN3P54252 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATXN3P54252 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATXN3P54252 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATXN3P54252 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATXN3P54252 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ATXN3P54252 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATXN3P54252 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATXN3P54252 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATXN3P54252 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATXN3P54252 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATXN3P54252 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATXN3P54252 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATXN3P54252 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATXN3P54252 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATXN3P54252 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATXN3P54252 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATXN3P54252 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ATXN3P54252 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATXN3P54252 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATXN3P54252 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATXN3P54252 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATXN3P54252 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATXN3P54252 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATXN3P54252 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATXN3P54252 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATXN3P54252 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATXN3P54252 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATXN3P54252 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ATXN3P54252 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATXN3P54252 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ATXN3P54252 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ATXN3P54252 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATXN3P54252 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATXN3P54252 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATXN3P54252 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATXN3P54252 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATXN3P54252 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATXN3P54252 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATXN3P54252 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATXN3P54252 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATXN3P54252 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATXN3P54252 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATXN3P54252 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATXN3P54252 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATXN3P54252 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATXN3P54252 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms