Protein–RNA interactions for Protein: P54136

RARS, Arginine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARSP54136 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
RARSP54136 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
RARSP54136 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
RARSP54136 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
RARSP54136 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
RARSP54136 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
RARSP54136 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
RARSP54136 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
RARSP54136 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
RARSP54136 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
RARSP54136 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
RARSP54136 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC31.89■■■□□ 2.7
RARSP54136 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
RARSP54136 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
RARSP54136 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
RARSP54136 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
RARSP54136 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
RARSP54136 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
RARSP54136 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
RARSP54136 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
RARSP54136 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
RARSP54136 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
RARSP54136 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
RARSP54136 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
RARSP54136 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
RARSP54136 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
RARSP54136 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
RARSP54136 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
RARSP54136 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
RARSP54136 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
RARSP54136 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
RARSP54136 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
RARSP54136 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
RARSP54136 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
RARSP54136 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
RARSP54136 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
RARSP54136 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
RARSP54136 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
RARSP54136 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
RARSP54136 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
RARSP54136 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
RARSP54136 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.69
RARSP54136 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
RARSP54136 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
RARSP54136 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
RARSP54136 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
RARSP54136 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
RARSP54136 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
RARSP54136 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
RARSP54136 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
RARSP54136 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
RARSP54136 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
RARSP54136 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC31.79■■■□□ 2.68
RARSP54136 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
RARSP54136 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
RARSP54136 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
RARSP54136 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
RARSP54136 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
RARSP54136 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
RARSP54136 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
RARSP54136 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
RARSP54136 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
RARSP54136 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
RARSP54136 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
RARSP54136 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
RARSP54136 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
RARSP54136 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
RARSP54136 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
RARSP54136 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
RARSP54136 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
RARSP54136 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
RARSP54136 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
RARSP54136 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
RARSP54136 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
RARSP54136 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
RARSP54136 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
RARSP54136 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
RARSP54136 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
RARSP54136 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
RARSP54136 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
RARSP54136 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
RARSP54136 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
RARSP54136 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
RARSP54136 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
RARSP54136 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
RARSP54136 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
RARSP54136 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
RARSP54136 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
RARSP54136 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
RARSP54136 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
RARSP54136 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
RARSP54136 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
RARSP54136 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
RARSP54136 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
RARSP54136 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
RARSP54136 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
RARSP54136 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
RARSP54136 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
RARSP54136 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
RARSP54136 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms