Protein–RNA interactions for Protein: P54108

CRISP3, Cysteine-rich secretory protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP3P54108 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRISP3P54108 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRISP3P54108 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRISP3P54108 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRISP3P54108 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRISP3P54108 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CRISP3P54108 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRISP3P54108 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRISP3P54108 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRISP3P54108 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRISP3P54108 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRISP3P54108 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRISP3P54108 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRISP3P54108 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CRISP3P54108 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CRISP3P54108 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRISP3P54108 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRISP3P54108 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRISP3P54108 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CRISP3P54108 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRISP3P54108 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRISP3P54108 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CRISP3P54108 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CRISP3P54108 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CRISP3P54108 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CRISP3P54108 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CRISP3P54108 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CRISP3P54108 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CRISP3P54108 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CRISP3P54108 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CRISP3P54108 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRISP3P54108 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRISP3P54108 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRISP3P54108 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRISP3P54108 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRISP3P54108 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRISP3P54108 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRISP3P54108 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRISP3P54108 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRISP3P54108 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRISP3P54108 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRISP3P54108 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRISP3P54108 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRISP3P54108 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRISP3P54108 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CRISP3P54108 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRISP3P54108 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRISP3P54108 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRISP3P54108 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRISP3P54108 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRISP3P54108 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRISP3P54108 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRISP3P54108 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRISP3P54108 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CRISP3P54108 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRISP3P54108 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRISP3P54108 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRISP3P54108 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRISP3P54108 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRISP3P54108 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRISP3P54108 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRISP3P54108 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CRISP3P54108 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CRISP3P54108 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CRISP3P54108 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRISP3P54108 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRISP3P54108 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRISP3P54108 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRISP3P54108 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRISP3P54108 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRISP3P54108 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRISP3P54108 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRISP3P54108 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRISP3P54108 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRISP3P54108 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRISP3P54108 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRISP3P54108 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRISP3P54108 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRISP3P54108 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRISP3P54108 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRISP3P54108 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CRISP3P54108 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CRISP3P54108 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CRISP3P54108 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CRISP3P54108 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CRISP3P54108 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRISP3P54108 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRISP3P54108 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRISP3P54108 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRISP3P54108 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRISP3P54108 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRISP3P54108 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRISP3P54108 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRISP3P54108 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRISP3P54108 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRISP3P54108 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRISP3P54108 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRISP3P54108 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CRISP3P54108 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRISP3P54108 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms