Protein–RNA interactions for Protein: P53384

NUBP1, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP1, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP1P53384 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUBP1P53384 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUBP1P53384 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUBP1P53384 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUBP1P53384 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUBP1P53384 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUBP1P53384 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUBP1P53384 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUBP1P53384 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUBP1P53384 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUBP1P53384 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUBP1P53384 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUBP1P53384 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUBP1P53384 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUBP1P53384 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUBP1P53384 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUBP1P53384 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUBP1P53384 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUBP1P53384 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUBP1P53384 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUBP1P53384 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUBP1P53384 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NUBP1P53384 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUBP1P53384 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUBP1P53384 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUBP1P53384 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUBP1P53384 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUBP1P53384 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUBP1P53384 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUBP1P53384 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUBP1P53384 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUBP1P53384 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NUBP1P53384 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUBP1P53384 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NUBP1P53384 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUBP1P53384 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUBP1P53384 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUBP1P53384 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUBP1P53384 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUBP1P53384 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUBP1P53384 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUBP1P53384 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUBP1P53384 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUBP1P53384 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUBP1P53384 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUBP1P53384 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUBP1P53384 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUBP1P53384 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUBP1P53384 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUBP1P53384 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUBP1P53384 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUBP1P53384 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUBP1P53384 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUBP1P53384 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUBP1P53384 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUBP1P53384 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUBP1P53384 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUBP1P53384 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUBP1P53384 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUBP1P53384 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUBP1P53384 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUBP1P53384 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUBP1P53384 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUBP1P53384 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUBP1P53384 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUBP1P53384 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUBP1P53384 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUBP1P53384 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUBP1P53384 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUBP1P53384 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUBP1P53384 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUBP1P53384 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUBP1P53384 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUBP1P53384 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NUBP1P53384 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUBP1P53384 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUBP1P53384 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUBP1P53384 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUBP1P53384 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUBP1P53384 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NUBP1P53384 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUBP1P53384 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUBP1P53384 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUBP1P53384 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NUBP1P53384 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NUBP1P53384 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUBP1P53384 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUBP1P53384 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUBP1P53384 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUBP1P53384 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUBP1P53384 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUBP1P53384 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUBP1P53384 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUBP1P53384 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUBP1P53384 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUBP1P53384 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUBP1P53384 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUBP1P53384 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUBP1P53384 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUBP1P53384 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms