Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARFIP1P53367 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARFIP1P53367 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ARFIP1P53367 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARFIP1P53367 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARFIP1P53367 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARFIP1P53367 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARFIP1P53367 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARFIP1P53367 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARFIP1P53367 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARFIP1P53367 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARFIP1P53367 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARFIP1P53367 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ARFIP1P53367 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARFIP1P53367 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARFIP1P53367 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARFIP1P53367 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARFIP1P53367 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARFIP1P53367 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARFIP1P53367 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARFIP1P53367 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARFIP1P53367 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARFIP1P53367 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARFIP1P53367 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARFIP1P53367 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARFIP1P53367 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARFIP1P53367 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARFIP1P53367 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARFIP1P53367 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARFIP1P53367 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARFIP1P53367 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARFIP1P53367 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARFIP1P53367 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARFIP1P53367 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARFIP1P53367 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARFIP1P53367 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARFIP1P53367 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARFIP1P53367 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARFIP1P53367 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARFIP1P53367 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARFIP1P53367 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARFIP1P53367 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFIP1P53367 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFIP1P53367 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFIP1P53367 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFIP1P53367 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARFIP1P53367 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARFIP1P53367 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ARFIP1P53367 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARFIP1P53367 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARFIP1P53367 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARFIP1P53367 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFIP1P53367 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFIP1P53367 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFIP1P53367 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFIP1P53367 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFIP1P53367 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFIP1P53367 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFIP1P53367 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARFIP1P53367 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARFIP1P53367 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFIP1P53367 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFIP1P53367 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFIP1P53367 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFIP1P53367 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFIP1P53367 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFIP1P53367 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFIP1P53367 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARFIP1P53367 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARFIP1P53367 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARFIP1P53367 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARFIP1P53367 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARFIP1P53367 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARFIP1P53367 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARFIP1P53367 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARFIP1P53367 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARFIP1P53367 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARFIP1P53367 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARFIP1P53367 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARFIP1P53367 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARFIP1P53367 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARFIP1P53367 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARFIP1P53367 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARFIP1P53367 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARFIP1P53367 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARFIP1P53367 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARFIP1P53367 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARFIP1P53367 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARFIP1P53367 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARFIP1P53367 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARFIP1P53367 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARFIP1P53367 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARFIP1P53367 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARFIP1P53367 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARFIP1P53367 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARFIP1P53367 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARFIP1P53367 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARFIP1P53367 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARFIP1P53367 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARFIP1P53367 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms