Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARFIP2P53365 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARFIP2P53365 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARFIP2P53365 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARFIP2P53365 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARFIP2P53365 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARFIP2P53365 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARFIP2P53365 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARFIP2P53365 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARFIP2P53365 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARFIP2P53365 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARFIP2P53365 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARFIP2P53365 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARFIP2P53365 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARFIP2P53365 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARFIP2P53365 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFIP2P53365 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFIP2P53365 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFIP2P53365 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFIP2P53365 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFIP2P53365 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFIP2P53365 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARFIP2P53365 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARFIP2P53365 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARFIP2P53365 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARFIP2P53365 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARFIP2P53365 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARFIP2P53365 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARFIP2P53365 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARFIP2P53365 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ARFIP2P53365 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARFIP2P53365 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARFIP2P53365 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARFIP2P53365 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARFIP2P53365 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARFIP2P53365 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARFIP2P53365 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARFIP2P53365 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARFIP2P53365 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARFIP2P53365 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARFIP2P53365 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARFIP2P53365 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARFIP2P53365 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARFIP2P53365 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARFIP2P53365 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARFIP2P53365 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARFIP2P53365 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARFIP2P53365 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARFIP2P53365 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARFIP2P53365 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARFIP2P53365 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARFIP2P53365 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARFIP2P53365 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARFIP2P53365 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARFIP2P53365 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ARFIP2P53365 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARFIP2P53365 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARFIP2P53365 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARFIP2P53365 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARFIP2P53365 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARFIP2P53365 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARFIP2P53365 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARFIP2P53365 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARFIP2P53365 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARFIP2P53365 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARFIP2P53365 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARFIP2P53365 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARFIP2P53365 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARFIP2P53365 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARFIP2P53365 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARFIP2P53365 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARFIP2P53365 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
ARFIP2P53365 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARFIP2P53365 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFIP2P53365 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFIP2P53365 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFIP2P53365 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFIP2P53365 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFIP2P53365 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFIP2P53365 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFIP2P53365 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFIP2P53365 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFIP2P53365 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFIP2P53365 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARFIP2P53365 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARFIP2P53365 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARFIP2P53365 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARFIP2P53365 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARFIP2P53365 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARFIP2P53365 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARFIP2P53365 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARFIP2P53365 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARFIP2P53365 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARFIP2P53365 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARFIP2P53365 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ARFIP2P53365 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARFIP2P53365 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARFIP2P53365 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARFIP2P53365 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARFIP2P53365 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms