Protein–RNA interactions for Protein: P51571

SSR4, Translocon-associated protein subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4P51571 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSR4P51571 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSR4P51571 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SSR4P51571 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSR4P51571 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSR4P51571 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSR4P51571 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SSR4P51571 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSR4P51571 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSR4P51571 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSR4P51571 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSR4P51571 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSR4P51571 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSR4P51571 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSR4P51571 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSR4P51571 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSR4P51571 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSR4P51571 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSR4P51571 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSR4P51571 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSR4P51571 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSR4P51571 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSR4P51571 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSR4P51571 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSR4P51571 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSR4P51571 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSR4P51571 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSR4P51571 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SSR4P51571 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSR4P51571 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSR4P51571 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SSR4P51571 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSR4P51571 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SSR4P51571 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSR4P51571 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSR4P51571 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSR4P51571 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSR4P51571 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSR4P51571 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSR4P51571 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSR4P51571 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SSR4P51571 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSR4P51571 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSR4P51571 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSR4P51571 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSR4P51571 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSR4P51571 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSR4P51571 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSR4P51571 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSR4P51571 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSR4P51571 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSR4P51571 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSR4P51571 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSR4P51571 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSR4P51571 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSR4P51571 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSR4P51571 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSR4P51571 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SSR4P51571 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSR4P51571 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSR4P51571 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SSR4P51571 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSR4P51571 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSR4P51571 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SSR4P51571 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSR4P51571 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSR4P51571 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSR4P51571 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSR4P51571 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSR4P51571 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSR4P51571 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSR4P51571 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSR4P51571 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSR4P51571 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSR4P51571 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSR4P51571 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSR4P51571 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSR4P51571 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSR4P51571 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSR4P51571 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSR4P51571 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSR4P51571 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSR4P51571 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSR4P51571 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSR4P51571 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSR4P51571 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSR4P51571 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SSR4P51571 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SSR4P51571 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSR4P51571 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SSR4P51571 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSR4P51571 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSR4P51571 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSR4P51571 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSR4P51571 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSR4P51571 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SSR4P51571 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSR4P51571 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SSR4P51571 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSR4P51571 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms