Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DAP3P51398 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DAP3P51398 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DAP3P51398 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DAP3P51398 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DAP3P51398 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DAP3P51398 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DAP3P51398 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DAP3P51398 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DAP3P51398 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DAP3P51398 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DAP3P51398 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DAP3P51398 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DAP3P51398 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DAP3P51398 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DAP3P51398 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DAP3P51398 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DAP3P51398 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DAP3P51398 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
DAP3P51398 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DAP3P51398 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DAP3P51398 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DAP3P51398 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DAP3P51398 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DAP3P51398 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DAP3P51398 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DAP3P51398 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DAP3P51398 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DAP3P51398 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DAP3P51398 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DAP3P51398 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DAP3P51398 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DAP3P51398 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DAP3P51398 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DAP3P51398 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DAP3P51398 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DAP3P51398 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DAP3P51398 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DAP3P51398 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DAP3P51398 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DAP3P51398 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DAP3P51398 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DAP3P51398 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DAP3P51398 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DAP3P51398 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DAP3P51398 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DAP3P51398 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DAP3P51398 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DAP3P51398 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DAP3P51398 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DAP3P51398 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DAP3P51398 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DAP3P51398 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DAP3P51398 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DAP3P51398 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DAP3P51398 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DAP3P51398 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DAP3P51398 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DAP3P51398 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DAP3P51398 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DAP3P51398 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DAP3P51398 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DAP3P51398 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DAP3P51398 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DAP3P51398 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DAP3P51398 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DAP3P51398 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DAP3P51398 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DAP3P51398 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DAP3P51398 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DAP3P51398 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DAP3P51398 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DAP3P51398 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DAP3P51398 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DAP3P51398 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DAP3P51398 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DAP3P51398 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DAP3P51398 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DAP3P51398 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DAP3P51398 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DAP3P51398 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DAP3P51398 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DAP3P51398 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DAP3P51398 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DAP3P51398 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DAP3P51398 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DAP3P51398 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DAP3P51398 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DAP3P51398 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DAP3P51398 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DAP3P51398 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
DAP3P51398 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DAP3P51398 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DAP3P51398 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DAP3P51398 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DAP3P51398 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DAP3P51398 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DAP3P51398 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DAP3P51398 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DAP3P51398 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms