Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GSK3BP49841 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GSK3BP49841 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GSK3BP49841 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSK3BP49841 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSK3BP49841 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSK3BP49841 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSK3BP49841 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSK3BP49841 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSK3BP49841 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSK3BP49841 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSK3BP49841 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSK3BP49841 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSK3BP49841 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSK3BP49841 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSK3BP49841 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GSK3BP49841 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GSK3BP49841 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSK3BP49841 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSK3BP49841 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSK3BP49841 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSK3BP49841 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GSK3BP49841 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSK3BP49841 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSK3BP49841 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSK3BP49841 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GSK3BP49841 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GSK3BP49841 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GSK3BP49841 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GSK3BP49841 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GSK3BP49841 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GSK3BP49841 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GSK3BP49841 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GSK3BP49841 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GSK3BP49841 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GSK3BP49841 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GSK3BP49841 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GSK3BP49841 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GSK3BP49841 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GSK3BP49841 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GSK3BP49841 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GSK3BP49841 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GSK3BP49841 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GSK3BP49841 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GSK3BP49841 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GSK3BP49841 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GSK3BP49841 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GSK3BP49841 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GSK3BP49841 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GSK3BP49841 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GSK3BP49841 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GSK3BP49841 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GSK3BP49841 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GSK3BP49841 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GSK3BP49841 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GSK3BP49841 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GSK3BP49841 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GSK3BP49841 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GSK3BP49841 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GSK3BP49841 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GSK3BP49841 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GSK3BP49841 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GSK3BP49841 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GSK3BP49841 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GSK3BP49841 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GSK3BP49841 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GSK3BP49841 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GSK3BP49841 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GSK3BP49841 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GSK3BP49841 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GSK3BP49841 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GSK3BP49841 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GSK3BP49841 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GSK3BP49841 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GSK3BP49841 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GSK3BP49841 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GSK3BP49841 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GSK3BP49841 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GSK3BP49841 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GSK3BP49841 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GSK3BP49841 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GSK3BP49841 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GSK3BP49841 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSK3BP49841 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSK3BP49841 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSK3BP49841 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSK3BP49841 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSK3BP49841 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GSK3BP49841 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GSK3BP49841 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GSK3BP49841 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GSK3BP49841 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GSK3BP49841 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GSK3BP49841 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GSK3BP49841 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GSK3BP49841 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GSK3BP49841 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GSK3BP49841 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GSK3BP49841 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GSK3BP49841 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms