Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC11A1P49279 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC11A1P49279 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC11A1P49279 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC11A1P49279 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC11A1P49279 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC11A1P49279 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC11A1P49279 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC11A1P49279 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC11A1P49279 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC11A1P49279 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC11A1P49279 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC11A1P49279 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC11A1P49279 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SLC11A1P49279 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SLC11A1P49279 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC11A1P49279 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC11A1P49279 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC11A1P49279 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC11A1P49279 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC11A1P49279 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC11A1P49279 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC11A1P49279 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC11A1P49279 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC11A1P49279 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC11A1P49279 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC11A1P49279 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC11A1P49279 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC11A1P49279 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC11A1P49279 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC11A1P49279 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC11A1P49279 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC11A1P49279 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC11A1P49279 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC11A1P49279 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC11A1P49279 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC11A1P49279 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC11A1P49279 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC11A1P49279 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC11A1P49279 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC11A1P49279 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC11A1P49279 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC11A1P49279 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC11A1P49279 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC11A1P49279 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC11A1P49279 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
SLC11A1P49279 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC11A1P49279 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC11A1P49279 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC11A1P49279 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC11A1P49279 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC11A1P49279 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC11A1P49279 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC11A1P49279 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC11A1P49279 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC11A1P49279 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC11A1P49279 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC11A1P49279 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC11A1P49279 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC11A1P49279 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC11A1P49279 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC11A1P49279 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC11A1P49279 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC11A1P49279 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC11A1P49279 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC11A1P49279 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC11A1P49279 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC11A1P49279 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SLC11A1P49279 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC11A1P49279 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC11A1P49279 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC11A1P49279 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC11A1P49279 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC11A1P49279 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC11A1P49279 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC11A1P49279 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC11A1P49279 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC11A1P49279 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC11A1P49279 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC11A1P49279 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC11A1P49279 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC11A1P49279 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC11A1P49279 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC11A1P49279 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC11A1P49279 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC11A1P49279 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC11A1P49279 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC11A1P49279 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC11A1P49279 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC11A1P49279 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC11A1P49279 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC11A1P49279 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC11A1P49279 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC11A1P49279 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLC11A1P49279 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC11A1P49279 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC11A1P49279 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC11A1P49279 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC11A1P49279 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC11A1P49279 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms