Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPC1P48995 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPC1P48995 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPC1P48995 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPC1P48995 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPC1P48995 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPC1P48995 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPC1P48995 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRPC1P48995 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRPC1P48995 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRPC1P48995 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRPC1P48995 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRPC1P48995 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRPC1P48995 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRPC1P48995 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRPC1P48995 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRPC1P48995 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRPC1P48995 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRPC1P48995 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRPC1P48995 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRPC1P48995 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRPC1P48995 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRPC1P48995 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRPC1P48995 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRPC1P48995 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRPC1P48995 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRPC1P48995 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRPC1P48995 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRPC1P48995 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRPC1P48995 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRPC1P48995 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TRPC1P48995 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRPC1P48995 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRPC1P48995 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRPC1P48995 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRPC1P48995 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRPC1P48995 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRPC1P48995 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRPC1P48995 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRPC1P48995 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TRPC1P48995 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRPC1P48995 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRPC1P48995 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TRPC1P48995 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRPC1P48995 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TRPC1P48995 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TRPC1P48995 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRPC1P48995 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRPC1P48995 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRPC1P48995 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRPC1P48995 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRPC1P48995 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRPC1P48995 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRPC1P48995 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRPC1P48995 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRPC1P48995 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRPC1P48995 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRPC1P48995 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPC1P48995 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPC1P48995 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPC1P48995 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPC1P48995 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPC1P48995 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPC1P48995 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPC1P48995 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPC1P48995 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPC1P48995 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPC1P48995 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPC1P48995 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPC1P48995 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPC1P48995 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPC1P48995 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPC1P48995 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPC1P48995 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRPC1P48995 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRPC1P48995 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRPC1P48995 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRPC1P48995 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPC1P48995 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPC1P48995 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPC1P48995 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPC1P48995 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPC1P48995 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPC1P48995 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPC1P48995 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPC1P48995 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPC1P48995 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPC1P48995 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPC1P48995 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPC1P48995 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPC1P48995 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPC1P48995 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPC1P48995 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPC1P48995 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPC1P48995 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPC1P48995 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPC1P48995 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPC1P48995 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPC1P48995 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPC1P48995 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms