Protein–RNA interactions for Protein: P48960

CD97, CD97 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD97P48960 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD97P48960 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD97P48960 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD97P48960 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD97P48960 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD97P48960 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CD97P48960 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD97P48960 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD97P48960 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CD97P48960 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD97P48960 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD97P48960 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CD97P48960 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD97P48960 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD97P48960 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD97P48960 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD97P48960 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CD97P48960 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD97P48960 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD97P48960 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD97P48960 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD97P48960 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD97P48960 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD97P48960 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD97P48960 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD97P48960 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD97P48960 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD97P48960 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD97P48960 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD97P48960 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD97P48960 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD97P48960 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD97P48960 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD97P48960 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CD97P48960 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD97P48960 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CD97P48960 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD97P48960 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD97P48960 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD97P48960 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD97P48960 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD97P48960 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD97P48960 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CD97P48960 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD97P48960 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD97P48960 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD97P48960 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CD97P48960 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD97P48960 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD97P48960 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD97P48960 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD97P48960 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD97P48960 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD97P48960 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD97P48960 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD97P48960 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD97P48960 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD97P48960 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD97P48960 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CD97P48960 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD97P48960 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD97P48960 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD97P48960 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD97P48960 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD97P48960 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CD97P48960 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD97P48960 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD97P48960 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD97P48960 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD97P48960 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD97P48960 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD97P48960 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD97P48960 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD97P48960 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD97P48960 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CD97P48960 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD97P48960 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD97P48960 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD97P48960 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD97P48960 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD97P48960 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD97P48960 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD97P48960 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CD97P48960 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD97P48960 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD97P48960 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD97P48960 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD97P48960 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD97P48960 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD97P48960 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD97P48960 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CD97P48960 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD97P48960 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CD97P48960 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD97P48960 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD97P48960 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD97P48960 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD97P48960 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD97P48960 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD97P48960 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms