Protein–RNA interactions for Protein: P48729

CSNK1A1, Casein kinase I isoform alpha, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1A1P48729 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSNK1A1P48729 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSNK1A1P48729 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSNK1A1P48729 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSNK1A1P48729 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSNK1A1P48729 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSNK1A1P48729 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSNK1A1P48729 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSNK1A1P48729 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSNK1A1P48729 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSNK1A1P48729 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSNK1A1P48729 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSNK1A1P48729 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSNK1A1P48729 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSNK1A1P48729 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSNK1A1P48729 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSNK1A1P48729 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSNK1A1P48729 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSNK1A1P48729 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSNK1A1P48729 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSNK1A1P48729 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSNK1A1P48729 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSNK1A1P48729 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSNK1A1P48729 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSNK1A1P48729 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSNK1A1P48729 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSNK1A1P48729 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSNK1A1P48729 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSNK1A1P48729 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSNK1A1P48729 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSNK1A1P48729 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSNK1A1P48729 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSNK1A1P48729 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSNK1A1P48729 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSNK1A1P48729 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSNK1A1P48729 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSNK1A1P48729 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSNK1A1P48729 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSNK1A1P48729 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSNK1A1P48729 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSNK1A1P48729 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CSNK1A1P48729 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CSNK1A1P48729 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSNK1A1P48729 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSNK1A1P48729 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSNK1A1P48729 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSNK1A1P48729 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSNK1A1P48729 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSNK1A1P48729 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSNK1A1P48729 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CSNK1A1P48729 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSNK1A1P48729 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSNK1A1P48729 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSNK1A1P48729 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSNK1A1P48729 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSNK1A1P48729 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSNK1A1P48729 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSNK1A1P48729 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSNK1A1P48729 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSNK1A1P48729 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSNK1A1P48729 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSNK1A1P48729 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSNK1A1P48729 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CSNK1A1P48729 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CSNK1A1P48729 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSNK1A1P48729 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSNK1A1P48729 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSNK1A1P48729 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSNK1A1P48729 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSNK1A1P48729 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSNK1A1P48729 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSNK1A1P48729 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSNK1A1P48729 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSNK1A1P48729 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CSNK1A1P48729 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSNK1A1P48729 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSNK1A1P48729 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSNK1A1P48729 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSNK1A1P48729 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSNK1A1P48729 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSNK1A1P48729 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSNK1A1P48729 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSNK1A1P48729 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSNK1A1P48729 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSNK1A1P48729 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSNK1A1P48729 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSNK1A1P48729 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSNK1A1P48729 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSNK1A1P48729 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSNK1A1P48729 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSNK1A1P48729 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSNK1A1P48729 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSNK1A1P48729 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSNK1A1P48729 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSNK1A1P48729 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSNK1A1P48729 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSNK1A1P48729 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSNK1A1P48729 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSNK1A1P48729 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSNK1A1P48729 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms