Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GJA8P48165 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GJA8P48165 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
GJA8P48165 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GJA8P48165 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GJA8P48165 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GJA8P48165 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GJA8P48165 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GJA8P48165 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GJA8P48165 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GJA8P48165 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GJA8P48165 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GJA8P48165 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
GJA8P48165 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GJA8P48165 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
GJA8P48165 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GJA8P48165 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GJA8P48165 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GJA8P48165 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GJA8P48165 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GJA8P48165 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GJA8P48165 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GJA8P48165 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
GJA8P48165 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GJA8P48165 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GJA8P48165 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GJA8P48165 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GJA8P48165 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GJA8P48165 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GJA8P48165 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GJA8P48165 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GJA8P48165 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GJA8P48165 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GJA8P48165 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GJA8P48165 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GJA8P48165 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GJA8P48165 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GJA8P48165 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GJA8P48165 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GJA8P48165 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GJA8P48165 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GJA8P48165 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GJA8P48165 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GJA8P48165 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GJA8P48165 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GJA8P48165 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJA8P48165 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
GJA8P48165 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJA8P48165 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJA8P48165 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJA8P48165 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJA8P48165 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GJA8P48165 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GJA8P48165 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GJA8P48165 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GJA8P48165 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
GJA8P48165 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GJA8P48165 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GJA8P48165 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GJA8P48165 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GJA8P48165 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
GJA8P48165 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GJA8P48165 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GJA8P48165 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GJA8P48165 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GJA8P48165 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GJA8P48165 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GJA8P48165 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GJA8P48165 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GJA8P48165 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GJA8P48165 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
GJA8P48165 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GJA8P48165 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GJA8P48165 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GJA8P48165 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GJA8P48165 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GJA8P48165 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GJA8P48165 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GJA8P48165 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GJA8P48165 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GJA8P48165 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GJA8P48165 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GJA8P48165 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GJA8P48165 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GJA8P48165 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GJA8P48165 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GJA8P48165 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GJA8P48165 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GJA8P48165 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GJA8P48165 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GJA8P48165 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GJA8P48165 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GJA8P48165 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GJA8P48165 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GJA8P48165 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GJA8P48165 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GJA8P48165 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GJA8P48165 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GJA8P48165 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GJA8P48165 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms