Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RECQLP46063 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RECQLP46063 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RECQLP46063 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RECQLP46063 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RECQLP46063 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RECQLP46063 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RECQLP46063 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RECQLP46063 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RECQLP46063 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RECQLP46063 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RECQLP46063 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RECQLP46063 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RECQLP46063 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RECQLP46063 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RECQLP46063 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RECQLP46063 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RECQLP46063 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RECQLP46063 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RECQLP46063 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RECQLP46063 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RECQLP46063 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RECQLP46063 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RECQLP46063 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RECQLP46063 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RECQLP46063 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RECQLP46063 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RECQLP46063 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RECQLP46063 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RECQLP46063 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RECQLP46063 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RECQLP46063 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RECQLP46063 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RECQLP46063 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RECQLP46063 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RECQLP46063 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RECQLP46063 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RECQLP46063 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RECQLP46063 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RECQLP46063 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RECQLP46063 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RECQLP46063 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RECQLP46063 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RECQLP46063 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RECQLP46063 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RECQLP46063 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RECQLP46063 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RECQLP46063 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RECQLP46063 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RECQLP46063 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RECQLP46063 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RECQLP46063 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RECQLP46063 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RECQLP46063 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RECQLP46063 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RECQLP46063 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RECQLP46063 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RECQLP46063 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RECQLP46063 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RECQLP46063 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RECQLP46063 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RECQLP46063 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RECQLP46063 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RECQLP46063 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RECQLP46063 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RECQLP46063 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RECQLP46063 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RECQLP46063 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RECQLP46063 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RECQLP46063 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RECQLP46063 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RECQLP46063 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RECQLP46063 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RECQLP46063 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RECQLP46063 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RECQLP46063 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RECQLP46063 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RECQLP46063 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RECQLP46063 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RECQLP46063 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RECQLP46063 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RECQLP46063 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RECQLP46063 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RECQLP46063 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RECQLP46063 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RECQLP46063 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RECQLP46063 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RECQLP46063 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RECQLP46063 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RECQLP46063 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RECQLP46063 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RECQLP46063 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RECQLP46063 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RECQLP46063 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RECQLP46063 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RECQLP46063 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RECQLP46063 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RECQLP46063 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RECQLP46063 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RECQLP46063 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms