Protein–RNA interactions for Protein: P43358

MAGEA4, Melanoma-associated antigen 4, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA4P43358 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAGEA4P43358 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAGEA4P43358 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAGEA4P43358 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAGEA4P43358 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAGEA4P43358 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAGEA4P43358 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAGEA4P43358 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAGEA4P43358 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAGEA4P43358 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAGEA4P43358 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAGEA4P43358 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MAGEA4P43358 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAGEA4P43358 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAGEA4P43358 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MAGEA4P43358 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MAGEA4P43358 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MAGEA4P43358 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MAGEA4P43358 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MAGEA4P43358 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MAGEA4P43358 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MAGEA4P43358 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MAGEA4P43358 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MAGEA4P43358 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAGEA4P43358 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAGEA4P43358 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MAGEA4P43358 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MAGEA4P43358 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MAGEA4P43358 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MAGEA4P43358 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAGEA4P43358 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAGEA4P43358 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAGEA4P43358 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MAGEA4P43358 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAGEA4P43358 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAGEA4P43358 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAGEA4P43358 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAGEA4P43358 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAGEA4P43358 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAGEA4P43358 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAGEA4P43358 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MAGEA4P43358 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAGEA4P43358 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MAGEA4P43358 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MAGEA4P43358 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MAGEA4P43358 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MAGEA4P43358 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MAGEA4P43358 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MAGEA4P43358 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAGEA4P43358 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAGEA4P43358 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAGEA4P43358 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAGEA4P43358 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAGEA4P43358 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAGEA4P43358 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAGEA4P43358 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAGEA4P43358 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAGEA4P43358 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAGEA4P43358 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAGEA4P43358 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAGEA4P43358 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MAGEA4P43358 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MAGEA4P43358 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MAGEA4P43358 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MAGEA4P43358 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MAGEA4P43358 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MAGEA4P43358 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MAGEA4P43358 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MAGEA4P43358 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MAGEA4P43358 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MAGEA4P43358 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MAGEA4P43358 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MAGEA4P43358 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MAGEA4P43358 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MAGEA4P43358 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MAGEA4P43358 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MAGEA4P43358 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MAGEA4P43358 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MAGEA4P43358 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MAGEA4P43358 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MAGEA4P43358 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MAGEA4P43358 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MAGEA4P43358 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MAGEA4P43358 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MAGEA4P43358 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MAGEA4P43358 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MAGEA4P43358 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MAGEA4P43358 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MAGEA4P43358 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MAGEA4P43358 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MAGEA4P43358 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MAGEA4P43358 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MAGEA4P43358 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MAGEA4P43358 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MAGEA4P43358 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MAGEA4P43358 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MAGEA4P43358 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MAGEA4P43358 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MAGEA4P43358 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MAGEA4P43358 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms