Protein–RNA interactions for Protein: P43357

MAGEA3, Melanoma-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA3P43357 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MAGEA3P43357 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MAGEA3P43357 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MAGEA3P43357 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MAGEA3P43357 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MAGEA3P43357 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MAGEA3P43357 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MAGEA3P43357 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MAGEA3P43357 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MAGEA3P43357 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MAGEA3P43357 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MAGEA3P43357 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MAGEA3P43357 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MAGEA3P43357 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MAGEA3P43357 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MAGEA3P43357 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MAGEA3P43357 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MAGEA3P43357 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MAGEA3P43357 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MAGEA3P43357 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MAGEA3P43357 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MAGEA3P43357 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MAGEA3P43357 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MAGEA3P43357 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MAGEA3P43357 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MAGEA3P43357 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MAGEA3P43357 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MAGEA3P43357 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MAGEA3P43357 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MAGEA3P43357 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MAGEA3P43357 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MAGEA3P43357 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MAGEA3P43357 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MAGEA3P43357 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MAGEA3P43357 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MAGEA3P43357 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MAGEA3P43357 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MAGEA3P43357 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MAGEA3P43357 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MAGEA3P43357 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MAGEA3P43357 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MAGEA3P43357 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MAGEA3P43357 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MAGEA3P43357 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MAGEA3P43357 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MAGEA3P43357 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MAGEA3P43357 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MAGEA3P43357 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MAGEA3P43357 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MAGEA3P43357 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MAGEA3P43357 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MAGEA3P43357 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MAGEA3P43357 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MAGEA3P43357 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MAGEA3P43357 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MAGEA3P43357 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MAGEA3P43357 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MAGEA3P43357 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MAGEA3P43357 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MAGEA3P43357 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MAGEA3P43357 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MAGEA3P43357 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MAGEA3P43357 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MAGEA3P43357 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MAGEA3P43357 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MAGEA3P43357 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MAGEA3P43357 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MAGEA3P43357 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MAGEA3P43357 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MAGEA3P43357 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MAGEA3P43357 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MAGEA3P43357 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MAGEA3P43357 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MAGEA3P43357 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MAGEA3P43357 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MAGEA3P43357 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MAGEA3P43357 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MAGEA3P43357 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MAGEA3P43357 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MAGEA3P43357 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MAGEA3P43357 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MAGEA3P43357 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MAGEA3P43357 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MAGEA3P43357 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MAGEA3P43357 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MAGEA3P43357 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MAGEA3P43357 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MAGEA3P43357 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MAGEA3P43357 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MAGEA3P43357 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MAGEA3P43357 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MAGEA3P43357 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MAGEA3P43357 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MAGEA3P43357 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MAGEA3P43357 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MAGEA3P43357 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MAGEA3P43357 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MAGEA3P43357 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MAGEA3P43357 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MAGEA3P43357 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms