Protein–RNA interactions for Protein: P42857

NSG1, Neuron-specific protein family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSG1P42857 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSG1P42857 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSG1P42857 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NSG1P42857 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSG1P42857 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSG1P42857 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSG1P42857 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSG1P42857 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSG1P42857 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSG1P42857 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSG1P42857 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NSG1P42857 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSG1P42857 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSG1P42857 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSG1P42857 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSG1P42857 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSG1P42857 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSG1P42857 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSG1P42857 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSG1P42857 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSG1P42857 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSG1P42857 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSG1P42857 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSG1P42857 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSG1P42857 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSG1P42857 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSG1P42857 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSG1P42857 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSG1P42857 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSG1P42857 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSG1P42857 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSG1P42857 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSG1P42857 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSG1P42857 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSG1P42857 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSG1P42857 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NSG1P42857 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSG1P42857 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSG1P42857 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSG1P42857 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSG1P42857 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSG1P42857 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSG1P42857 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSG1P42857 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSG1P42857 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSG1P42857 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSG1P42857 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSG1P42857 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSG1P42857 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSG1P42857 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSG1P42857 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSG1P42857 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NSG1P42857 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSG1P42857 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSG1P42857 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSG1P42857 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSG1P42857 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSG1P42857 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSG1P42857 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSG1P42857 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSG1P42857 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NSG1P42857 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSG1P42857 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSG1P42857 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NSG1P42857 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NSG1P42857 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSG1P42857 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSG1P42857 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSG1P42857 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSG1P42857 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NSG1P42857 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSG1P42857 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSG1P42857 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSG1P42857 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSG1P42857 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSG1P42857 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSG1P42857 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSG1P42857 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSG1P42857 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSG1P42857 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSG1P42857 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSG1P42857 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSG1P42857 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSG1P42857 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSG1P42857 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSG1P42857 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NSG1P42857 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSG1P42857 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSG1P42857 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSG1P42857 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSG1P42857 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NSG1P42857 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSG1P42857 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSG1P42857 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSG1P42857 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSG1P42857 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSG1P42857 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSG1P42857 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSG1P42857 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSG1P42857 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms