Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PIK3CBP42338 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PIK3CBP42338 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PIK3CBP42338 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIK3CBP42338 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIK3CBP42338 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIK3CBP42338 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIK3CBP42338 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIK3CBP42338 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIK3CBP42338 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIK3CBP42338 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIK3CBP42338 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIK3CBP42338 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIK3CBP42338 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIK3CBP42338 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIK3CBP42338 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIK3CBP42338 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3CBP42338 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3CBP42338 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3CBP42338 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3CBP42338 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3CBP42338 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3CBP42338 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
PIK3CBP42338 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PIK3CBP42338 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PIK3CBP42338 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3CBP42338 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3CBP42338 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3CBP42338 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3CBP42338 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3CBP42338 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3CBP42338 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3CBP42338 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3CBP42338 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3CBP42338 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3CBP42338 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3CBP42338 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3CBP42338 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3CBP42338 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PIK3CBP42338 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIK3CBP42338 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIK3CBP42338 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIK3CBP42338 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIK3CBP42338 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIK3CBP42338 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIK3CBP42338 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIK3CBP42338 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIK3CBP42338 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIK3CBP42338 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIK3CBP42338 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIK3CBP42338 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIK3CBP42338 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIK3CBP42338 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIK3CBP42338 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIK3CBP42338 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIK3CBP42338 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIK3CBP42338 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PIK3CBP42338 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PIK3CBP42338 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PIK3CBP42338 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PIK3CBP42338 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PIK3CBP42338 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PIK3CBP42338 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PIK3CBP42338 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIK3CBP42338 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIK3CBP42338 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIK3CBP42338 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIK3CBP42338 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIK3CBP42338 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIK3CBP42338 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PIK3CBP42338 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIK3CBP42338 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIK3CBP42338 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIK3CBP42338 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIK3CBP42338 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIK3CBP42338 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIK3CBP42338 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIK3CBP42338 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIK3CBP42338 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PIK3CBP42338 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3CBP42338 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3CBP42338 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3CBP42338 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIK3CBP42338 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIK3CBP42338 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIK3CBP42338 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIK3CBP42338 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIK3CBP42338 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PIK3CBP42338 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIK3CBP42338 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIK3CBP42338 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIK3CBP42338 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIK3CBP42338 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIK3CBP42338 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PIK3CBP42338 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIK3CBP42338 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIK3CBP42338 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIK3CBP42338 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIK3CBP42338 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIK3CBP42338 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms