Protein–RNA interactions for Protein: P42336

PIK3CA, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CAP42336 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIK3CAP42336 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIK3CAP42336 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIK3CAP42336 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIK3CAP42336 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIK3CAP42336 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIK3CAP42336 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIK3CAP42336 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIK3CAP42336 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIK3CAP42336 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIK3CAP42336 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIK3CAP42336 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIK3CAP42336 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIK3CAP42336 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIK3CAP42336 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIK3CAP42336 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PIK3CAP42336 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PIK3CAP42336 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PIK3CAP42336 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PIK3CAP42336 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PIK3CAP42336 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PIK3CAP42336 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PIK3CAP42336 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PIK3CAP42336 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PIK3CAP42336 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PIK3CAP42336 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PIK3CAP42336 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PIK3CAP42336 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PIK3CAP42336 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PIK3CAP42336 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PIK3CAP42336 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PIK3CAP42336 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PIK3CAP42336 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PIK3CAP42336 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIK3CAP42336 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIK3CAP42336 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIK3CAP42336 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIK3CAP42336 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIK3CAP42336 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIK3CAP42336 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PIK3CAP42336 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PIK3CAP42336 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PIK3CAP42336 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PIK3CAP42336 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PIK3CAP42336 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PIK3CAP42336 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PIK3CAP42336 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PIK3CAP42336 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PIK3CAP42336 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PIK3CAP42336 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PIK3CAP42336 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PIK3CAP42336 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PIK3CAP42336 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PIK3CAP42336 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PIK3CAP42336 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PIK3CAP42336 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PIK3CAP42336 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PIK3CAP42336 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PIK3CAP42336 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PIK3CAP42336 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PIK3CAP42336 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PIK3CAP42336 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PIK3CAP42336 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PIK3CAP42336 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PIK3CAP42336 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PIK3CAP42336 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PIK3CAP42336 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PIK3CAP42336 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PIK3CAP42336 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PIK3CAP42336 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PIK3CAP42336 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PIK3CAP42336 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PIK3CAP42336 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PIK3CAP42336 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PIK3CAP42336 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PIK3CAP42336 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PIK3CAP42336 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PIK3CAP42336 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PIK3CAP42336 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PIK3CAP42336 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PIK3CAP42336 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PIK3CAP42336 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PIK3CAP42336 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PIK3CAP42336 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PIK3CAP42336 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PIK3CAP42336 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PIK3CAP42336 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PIK3CAP42336 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PIK3CAP42336 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PIK3CAP42336 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PIK3CAP42336 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PIK3CAP42336 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PIK3CAP42336 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PIK3CAP42336 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PIK3CAP42336 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PIK3CAP42336 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PIK3CAP42336 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PIK3CAP42336 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PIK3CAP42336 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PIK3CAP42336 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms