Protein–RNA interactions for Protein: P41968

MC3R, Melanocortin receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC3RP41968 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MC3RP41968 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MC3RP41968 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MC3RP41968 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MC3RP41968 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MC3RP41968 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MC3RP41968 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MC3RP41968 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MC3RP41968 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MC3RP41968 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MC3RP41968 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MC3RP41968 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MC3RP41968 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MC3RP41968 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MC3RP41968 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MC3RP41968 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MC3RP41968 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MC3RP41968 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MC3RP41968 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MC3RP41968 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MC3RP41968 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MC3RP41968 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MC3RP41968 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MC3RP41968 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MC3RP41968 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MC3RP41968 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MC3RP41968 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MC3RP41968 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MC3RP41968 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MC3RP41968 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MC3RP41968 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MC3RP41968 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MC3RP41968 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MC3RP41968 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MC3RP41968 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MC3RP41968 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MC3RP41968 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MC3RP41968 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MC3RP41968 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MC3RP41968 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MC3RP41968 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MC3RP41968 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MC3RP41968 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MC3RP41968 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MC3RP41968 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MC3RP41968 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MC3RP41968 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MC3RP41968 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MC3RP41968 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MC3RP41968 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MC3RP41968 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MC3RP41968 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MC3RP41968 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MC3RP41968 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MC3RP41968 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MC3RP41968 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MC3RP41968 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MC3RP41968 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MC3RP41968 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MC3RP41968 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MC3RP41968 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MC3RP41968 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MC3RP41968 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MC3RP41968 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MC3RP41968 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MC3RP41968 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MC3RP41968 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MC3RP41968 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MC3RP41968 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MC3RP41968 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MC3RP41968 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MC3RP41968 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MC3RP41968 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MC3RP41968 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MC3RP41968 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MC3RP41968 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MC3RP41968 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MC3RP41968 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MC3RP41968 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MC3RP41968 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MC3RP41968 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MC3RP41968 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MC3RP41968 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MC3RP41968 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MC3RP41968 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MC3RP41968 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MC3RP41968 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MC3RP41968 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MC3RP41968 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MC3RP41968 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MC3RP41968 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MC3RP41968 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MC3RP41968 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MC3RP41968 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MC3RP41968 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MC3RP41968 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MC3RP41968 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MC3RP41968 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MC3RP41968 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MC3RP41968 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms