Protein–RNA interactions for Protein: P41743

PRKCI, Protein kinase C iota type, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCIP41743 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKCIP41743 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKCIP41743 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKCIP41743 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKCIP41743 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKCIP41743 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKCIP41743 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKCIP41743 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKCIP41743 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKCIP41743 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRKCIP41743 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRKCIP41743 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRKCIP41743 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRKCIP41743 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRKCIP41743 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRKCIP41743 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRKCIP41743 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRKCIP41743 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRKCIP41743 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRKCIP41743 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRKCIP41743 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRKCIP41743 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRKCIP41743 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRKCIP41743 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRKCIP41743 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRKCIP41743 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRKCIP41743 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRKCIP41743 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRKCIP41743 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKCIP41743 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKCIP41743 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKCIP41743 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKCIP41743 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKCIP41743 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKCIP41743 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKCIP41743 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKCIP41743 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKCIP41743 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKCIP41743 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKCIP41743 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKCIP41743 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKCIP41743 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKCIP41743 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKCIP41743 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKCIP41743 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKCIP41743 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKCIP41743 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKCIP41743 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKCIP41743 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKCIP41743 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKCIP41743 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKCIP41743 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKCIP41743 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKCIP41743 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKCIP41743 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKCIP41743 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKCIP41743 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKCIP41743 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKCIP41743 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKCIP41743 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKCIP41743 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKCIP41743 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKCIP41743 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKCIP41743 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKCIP41743 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKCIP41743 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKCIP41743 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKCIP41743 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKCIP41743 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRKCIP41743 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRKCIP41743 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRKCIP41743 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PRKCIP41743 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PRKCIP41743 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKCIP41743 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKCIP41743 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKCIP41743 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKCIP41743 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKCIP41743 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKCIP41743 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKCIP41743 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKCIP41743 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKCIP41743 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKCIP41743 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKCIP41743 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKCIP41743 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKCIP41743 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKCIP41743 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKCIP41743 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKCIP41743 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKCIP41743 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKCIP41743 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKCIP41743 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKCIP41743 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKCIP41743 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKCIP41743 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKCIP41743 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKCIP41743 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKCIP41743 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRKCIP41743 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms