Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBEC1P41238 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBEC1P41238 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBEC1P41238 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC1P41238 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC1P41238 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC1P41238 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC1P41238 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC1P41238 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC1P41238 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC1P41238 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC1P41238 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC1P41238 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC1P41238 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC1P41238 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC1P41238 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC1P41238 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC1P41238 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC1P41238 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC1P41238 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC1P41238 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC1P41238 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC1P41238 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC1P41238 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC1P41238 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOBEC1P41238 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOBEC1P41238 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOBEC1P41238 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC1P41238 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC1P41238 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC1P41238 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC1P41238 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC1P41238 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC1P41238 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC1P41238 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC1P41238 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC1P41238 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC1P41238 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC1P41238 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC1P41238 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC1P41238 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC1P41238 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC1P41238 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC1P41238 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC1P41238 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC1P41238 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC1P41238 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC1P41238 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC1P41238 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC1P41238 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC1P41238 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC1P41238 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC1P41238 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBEC1P41238 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBEC1P41238 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBEC1P41238 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
APOBEC1P41238 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
APOBEC1P41238 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC1P41238 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC1P41238 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC1P41238 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC1P41238 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC1P41238 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC1P41238 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC1P41238 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC1P41238 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC1P41238 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC1P41238 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC1P41238 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC1P41238 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC1P41238 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC1P41238 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC1P41238 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC1P41238 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC1P41238 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC1P41238 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC1P41238 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC1P41238 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC1P41238 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC1P41238 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC1P41238 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC1P41238 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC1P41238 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC1P41238 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBEC1P41238 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBEC1P41238 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC1P41238 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC1P41238 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC1P41238 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC1P41238 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBEC1P41238 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBEC1P41238 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBEC1P41238 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBEC1P41238 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBEC1P41238 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC1P41238 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC1P41238 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC1P41238 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC1P41238 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC1P41238 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms