Protein–RNA interactions for Protein: P38255

RXT2, Transcriptional regulatory protein RXT2, yeast

Predictions only

Length 430 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RXT2	P38255	ICP55	YER078C	1536 nt		7.73	□□□□□ -1.17
RXT2	P38255	HDA1	YNL021W	2121 nt		7.72	□□□□□ -1.17
RXT2	P38255	NUP49	YGL172W	1419 nt		7.72	□□□□□ -1.17
RXT2	P38255	SSC1	YJR045C	1965 nt		7.72	□□□□□ -1.17
RXT2	P38255	HOC1	YJR075W	1191 nt		7.72	□□□□□ -1.17
RXT2	P38255	PTC7	YHR076W	1032 nt		7.71	□□□□□ -1.18
RXT2	P38255	LIA1	YJR070C	978 nt		7.71	□□□□□ -1.18
RXT2	P38255	SRY1	YKL218C	981 nt		7.71	□□□□□ -1.18
RXT2	P38255	RPL31B	YLR406C	342 nt		7.71	□□□□□ -1.18
RXT2	P38255	SPG5	YMR191W	1122 nt		7.71	□□□□□ -1.18
RXT2	P38255	MSC3	YLR219W	2187 nt		7.71	□□□□□ -1.18
RXT2	P38255	VBA5	YKR105C	1749 nt		7.7	□□□□□ -1.18
RXT2	P38255	PRI1	YIR008C	1230 nt		7.7	□□□□□ -1.18
RXT2	P38255	YLL056C	YLL056C	897 nt		7.7	□□□□□ -1.18
RXT2	P38255	YLR112W	YLR112W	420 nt		7.7	□□□□□ -1.18
RXT2	P38255	ASR1	YPR093C	867 nt		7.7	□□□□□ -1.18
RXT2	P38255	SMX3	YPR182W	261 nt		7.7	□□□□□ -1.18
RXT2	P38255	NUP84	YDL116W	2181 nt		7.69	□□□□□ -1.18
RXT2	P38255	FCY22	YER060W-A	1593 nt		7.69	□□□□□ -1.18
RXT2	P38255	CEM1	YER061C	1329 nt		7.69	□□□□□ -1.18
RXT2	P38255	POB3	YML069W	1659 nt		7.69	□□□□□ -1.18
RXT2	P38255	FMP40	YPL222W	2067 nt		7.69	□□□□□ -1.18
RXT2	P38255	FCP1	YMR277W	2199 nt		7.69	□□□□□ -1.18
RXT2	P38255	GPD1	YDL022W	1176 nt		7.68	□□□□□ -1.18
RXT2	P38255	MRPL35	YDR322W	1104 nt		7.68	□□□□□ -1.18
RXT2	P38255	MRPS28	YDR337W	861 nt		7.68	□□□□□ -1.18
RXT2	P38255	SNT309	YPR101W	528 nt		7.68	□□□□□ -1.18
RXT2	P38255	LAS17	YOR181W	1902 nt		7.68	□□□□□ -1.18
RXT2	P38255	ASN2	YGR124W	1719 nt		7.67	□□□□□ -1.18
RXT2	P38255	MRPL19	YNL185C	477 nt		7.67	□□□□□ -1.18
RXT2	P38255	YOR012W	YOR012W	414 nt		7.67	□□□□□ -1.18
RXT2	P38255	RPL2B	YIL018W	765 nt		7.66	□□□□□ -1.18
RXT2	P38255	AIM2	YAL049C	741 nt		7.66	□□□□□ -1.18
RXT2	P38255	BNA3	YJL060W	1335 nt		7.66	□□□□□ -1.18
RXT2	P38255	CRH1	YGR189C	1524 nt		7.66	□□□□□ -1.18
RXT2	P38255	CBR1	YIL043C	855 nt		7.65	□□□□□ -1.18
RXT2	P38255	TUF1	YOR187W	1314 nt		7.65	□□□□□ -1.18
RXT2	P38255	SEC62	YPL094C	825 nt		7.65	□□□□□ -1.18
RXT2	P38255	AMN1	YBR158W	1650 nt		7.64	□□□□□ -1.19
RXT2	P38255	URH1	YDR400W	1023 nt		7.64	□□□□□ -1.19
RXT2	P38255	MRPL28	YDR462W	444 nt		7.64	□□□□□ -1.19
RXT2	P38255	YOS9	YDR057W	1629 nt		7.63	□□□□□ -1.19
RXT2	P38255	LSC1	YOR142W	990 nt		7.63	□□□□□ -1.19
RXT2	P38255	NMD5	YJR132W	3147 nt		7.63	□□□□□ -1.19
RXT2	P38255	AQR1	YNL065W	1761 nt		7.62	□□□□□ -1.19
RXT2	P38255	LCL3	YGL085W	825 nt		7.62	□□□□□ -1.19
RXT2	P38255	POR2	YIL114C	846 nt		7.62	□□□□□ -1.19
RXT2	P38255	YHC3	YJL059W	1227 nt		7.62	□□□□□ -1.19
RXT2	P38255	RFS1	YBR052C	633 nt		7.62	□□□□□ -1.19
RXT2	P38255	YCR061W	YCR061W	1896 nt		7.62	□□□□□ -1.19
RXT2	P38255	HED1	YDR014W-A	489 nt		7.61	□□□□□ -1.19
RXT2	P38255	TRS31	YDR472W	852 nt		7.61	□□□□□ -1.19
RXT2	P38255	MTR3	YGR158C	753 nt		7.61	□□□□□ -1.19
RXT2	P38255	PMA2	YPL036W	2844 nt		7.61	□□□□□ -1.19
RXT2	P38255	RBS1	YDL189W	1374 nt		7.6	□□□□□ -1.19
RXT2	P38255	PAC2	YER007W	1557 nt		7.59	□□□□□ -1.19
RXT2	P38255	YKL102C	YKL102C	306 nt		7.59	□□□□□ -1.19
RXT2	P38255	FRT1	YOR324C	1809 nt		7.59	□□□□□ -1.19
RXT2	P38255	DOT1	YDR440W	1749 nt		7.58	□□□□□ -1.2
RXT2	P38255	YMR034C	YMR034C	1305 nt		7.58	□□□□□ -1.2
RXT2	P38255	ERS1	YCR075C	783 nt		7.58	□□□□□ -1.2
RXT2	P38255	YBR113W	YBR113W	483 nt		7.58	□□□□□ -1.2
RXT2	P38255	GPA1	YHR005C	1419 nt		7.58	□□□□□ -1.2
RXT2	P38255	RGT2	YDL138W	2292 nt		7.57	□□□□□ -1.2
RXT2	P38255	ASF1	YJL115W	840 nt		7.57	□□□□□ -1.2
RXT2	P38255	YKL018C-A	YKL018C-A	300 nt		7.57	□□□□□ -1.2
RXT2	P38255	YNL092W	YNL092W	1203 nt		7.57	□□□□□ -1.2
RXT2	P38255	YDL177C	YDL177C	513 nt		7.56	□□□□□ -1.2
RXT2	P38255	PMP3	YDR276C	168 nt		7.56	□□□□□ -1.2
RXT2	P38255	YSC83	YHR017W	1158 nt		7.56	□□□□□ -1.2
RXT2	P38255	YKL077W	YKL077W	1179 nt		7.56	□□□□□ -1.2
RXT2	P38255	SWD1	YAR003W	1281 nt		7.56	□□□□□ -1.2
RXT2	P38255	ILV6	YCL009C	930 nt		7.56	□□□□□ -1.2
RXT2	P38255	SAL1	YNL083W	1485 nt		7.55	□□□□□ -1.2
RXT2	P38255	MCH2	YKL221W	1422 nt		7.55	□□□□□ -1.2
RXT2	P38255	TAF9	YMR236W	474 nt		7.55	□□□□□ -1.2
RXT2	P38255	ARC35	YNR035C	1029 nt		7.55	□□□□□ -1.2
RXT2	P38255	PAC10	YGR078C	600 nt		7.54	□□□□□ -1.2
RXT2	P38255	FMO1	YHR176W	1299 nt		7.54	□□□□□ -1.2
RXT2	P38255	YIL029W-A	YIL029W-A	372 nt		7.54	□□□□□ -1.2
RXT2	P38255	RDN5-2	RDN5-2	119 nt		7.54	□□□□□ -1.2
RXT2	P38255	RDN5-3	RDN5-3	119 nt		7.54	□□□□□ -1.2
RXT2	P38255	RDN5-4	RDN5-4	119 nt		7.54	□□□□□ -1.2
RXT2	P38255	RDN5-5	RDN5-5	119 nt		7.54	□□□□□ -1.2
RXT2	P38255	TMA46	YOR091W	1038 nt		7.54	□□□□□ -1.2
RXT2	P38255	GFA1	YKL104C	2154 nt		7.53	□□□□□ -1.2
RXT2	P38255	AIM20	YIL158W	615 nt		7.53	□□□□□ -1.2
RXT2	P38255	MRPS18	YNL306W	654 nt		7.53	□□□□□ -1.2
RXT2	P38255	YHR020W	YHR020W	2067 nt		7.53	□□□□□ -1.2
RXT2	P38255	RGD2	YFL047W	2145 nt		7.52	□□□□□ -1.2
RXT2	P38255	YBR241C	YBR241C	1467 nt		7.52	□□□□□ -1.21
RXT2	P38255	SPG1	YGR236C	288 nt		7.52	□□□□□ -1.21
RXT2	P38255	HBN1	YCL026C-B	582 nt		7.52	□□□□□ -1.21
RXT2	P38255	EHD3	YDR036C	1503 nt		7.52	□□□□□ -1.21
RXT2	P38255	ADE17	YMR120C	1779 nt		7.51	□□□□□ -1.21
RXT2	P38255	HHY1	YEL059W	309 nt		7.51	□□□□□ -1.21
RXT2	P38255	RNH1	YMR234W	1047 nt		7.51	□□□□□ -1.21
RXT2	P38255	MRPL23	YOR150W	492 nt		7.51	□□□□□ -1.21
RXT2	P38255	PPM2	YOL141W	2088 nt		7.51	□□□□□ -1.21
RXT2	P38255	COQ1	YBR003W	1422 nt		7.51	□□□□□ -1.21

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.7 ms